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R のデータ構造とメモリ管理
R のメモリプロファイリングをしたかったんですが、表示される結果の意味が理解できなかったので、R の... R のメモリプロファイリングをしたかったんですが、表示される結果の意味が理解できなかったので、R のデータ構造とメモリ管理について調べてまとめてみました。 事の発端 Unix において、R のメモリ関連の関数には gc, gcinfo, Rprof, Rprofmem, tracemem, memory.profile, object.size あたりがあります。 例えば gc を実行すると次のような結果が得られます。 > gc() used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb) Ncells 180515 9.7 407500 21.8 350000 18.7 Vcells 287939 2.2 905753 7.0 877008 6.7 この結果について、gc のドキュメントには次のように書いてあります。 ‘gc’ returns a matrix wi