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t-sat t-sat ちょっと昔、アミノ酸配列とその力学を実装した「パズルゲーム」を公開してゲーマーに分散的に解かせ、結構良い成果が出てるという記事を読んだ覚えがあるが、あれどうなったんだろう?ゲーマー飽きちゃったんかな。

2019/01/19 リンク

zyzy zyzy ごそっとまとめて相互距離を取る手口、と言うのは素直な発想ではなかなかいかないよな。それこそ片っ端からいろんなやり方試したんだろうな……。で最終的にある種のシンプルなやり方に行き着いてるのがカッコイイ。

2019/01/15 リンク

dekaino dekaino タンパクのFolding計算か

2019/01/14 リンク

ks1234_1234 ks1234_1234 AlphaFold、A7d。なるほどわからん。まあ私でも分かるようなことなら記事にならない。

2019/01/13 リンク

timetrain timetrain 強化学習かと思ったら、強化学習で思考するには自然界がまだ複雑すぎるのか。碁盤は統一ルールがあるが、自然法則の再現モデルが最後に立ちはだかると思ってる

2019/01/13 リンク

ookitasaburou ookitasaburou “2018年は、2年に一度開催される国際タンパク質構造予測コンテスト(CASP)の行なわれる年であった。このコンテストはすでに初開催から25年の歴史*3を迎えようとしていて、毎回世界中から数百ものスポンサーを集め、組織委

2019/01/13 リンク

goodstoriez goodstoriez “DeepMindはこれらの伝統的な評価モデルを全て無視することを試したが、結局取り入れざるをえなかった。この事実から、長きにわたり研究者が知恵を絞ってきた伝統的アプローチも同じくらい重要といえるのではないか”

2019/01/13 リンク

asamaru asamaru 全く理解できない領域。すごいな。

2019/01/13 リンク

yasudayasu yasudayasu DeepMindは今回上で述べたモデルに、さらに一つ、いわば伝統的なfragmentation (まず計算モジュールを細かく分けて、のちにそれらの結果を統合する学習スタイル)を完全に無視する方法を取り入れている。

2019/01/12 リンク

Room-B Room-B 構造予測でも充分すごいが、もしもドッキング予測の精度が飛躍的に上がったら、製薬業界に大きな変化があるかも。

2019/01/12 リンク

kibarashi9 kibarashi9 なるほどわからん。

2019/01/12 リンク

natuboshi natuboshi 構造予測の手法の進化と課題。

2019/01/12 リンク

zu2 zu2 “そう、あのAlphaGoを開発したDeepMindである!報道によると、DeepMindはこのモデルをすでにAlphaFoldと名付けているそうだ”

2019/01/12 リンク

ntdtks ntdtks World Community GridのWorkUinit計算でのタンパク質等の折り畳みやパタンマッチにもロジック改良して速度アップできるといいな。

2019/01/12 リンク

ariyake ariyake イノベーションの頻度が指数関数的に加速してる感あるなあ

2019/01/12 リンク

suginoy suginoy Software Is Eating the World

2019/01/12 リンク

fatmonger fatmonger 素人なので産業への直接的な影響が全く想像できないんだけど、既存のバイオベンチャー株に悪影響あったら超困る。

2019/01/12 リンク

publicphysics publicphysics 1次配列だけ読んだらタンパクの構造がほぼわかって結合もBLASTみたいにランクで出て、そのtop5だけ免沈とかで確認すれば十分みたいな時代が来たらいいなー。GTP/GDPがハマった時とかシャペロンの仕事とかもよろしく。

2019/01/12 リンク

nminoru nminoru 「DeepMindは今回上で述べたモデルに、さらに一つ、いわば伝統的なfragmentation を完全に無視する方法を取り入れている」

2019/01/12 リンク

amino_acid9 amino_acid9 これからも様々な分野で「またお前らか!」が続きそう。構造生物学ついでにタンパク質結晶化条件の探索もなんとかしてくれると歓喜する人めっちゃいそう

2019/01/12 リンク

Cru Cru とんでもねー。

2019/01/12 リンク

kouhei_kain kouhei_kain 大昔にタンパク質の架橋接着酵素とか学んだ事があるのだけれどその頃は夢物語だったことが現実になってるなぁ。量子コンピューターの件と言い歴史上の特異点とか言われる時代の真っただ中に今いるのかもなぁ

2019/01/12 リンク

nasoft nasoft 眠たくなったけど全部読んだ

2019/01/12 リンク

Shin-JPN Shin-JPN >hitodie この件はそういう話ではないです。既存各モデルは、そもそも必要な計算量も加味して採用するアルゴを決めているわけで計算量を増やせば精度が上がるという代物ではないですし、AlphaFoldも強化学習を使ってません

2019/01/12 リンク

mbr mbr 構造バイオインフォ屋としてはこの話題がこれだけブクマを集めていること自体が素直に嬉しい(この前授業でも少し取り上げたし)/これでタンパク3000叩くのは筋が悪すぎ。大規模解析のデータあってのこの予測精度。

2019/01/12 リンク

H58 H58 なんか、込み入っているので直ぐに読めない。。

2019/01/12 リンク

terrask terrask なんか隔世の感がある。。。

2019/01/12 リンク

swingwings swingwings 読み物としても面白い

2019/01/12 リンク

hatomugicha hatomugicha あんま読んでないけど人工知能が偉業を達成したって記事を人々はどう受け取るのか気になっていて人工知能が何もないところから全て一から始めて人類を凌駕したみたいな受け取り方をするような記事はどう見られるのか

2019/01/12 リンク

aya_momo aya_momo この話、去年もはてブで見た気がする。/ちゃんと決めるには、量子力学に基づいてバカみたいに電気を使って計算しないといけないのよね。

2019/01/12 リンク

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