Single Cell RNA-seq解析で使用されるプロトコルのご紹介 - アメリエフの技術ブログ

お久しぶりです。kimotonです。 細胞状態の変化を観察したい 多様性の解析を行いたい 分化の分岐点を決定したい ヘテロな集団だからとりあえず。。 そんなあなたにSingle Cell RNA-seq解析です。 今回はSingle Cell RNA-seq技術のうち、代表的なプロトコルについてご紹介します！ レッツシングルセル！ Droplet型 この手法では、マイクロエマルジョン技術によりバーコードを含むゲルビーズと細胞を1つの油滴中に閉じ込め、 次世代シーケンサーによってシーケンスデータを取得します。 10X GenomicsのChromiumはこの方式となっています。 今やSingle Cell界隈において、Chromiumが70％ほどのシェアを占めているとか何とか。 Chromiumは、RNA-seqのみならずCITE-seqやATAC-seqなどの解析に対応していることも特徴的