理研、分子1つ1つを再現する細胞シミュレーション法を開発 次世代スパコンで細胞丸ごとシミュレーションを目指す « NODE 科学、技術、サブカル ニュース

理研、分子1つ1つを再現する細胞シミュレーション法を開発 次世代スパコンで細胞丸ごとシミュレーションを目指す 分子1つ1つの運動まで再現する細胞シミュレーション法を開発｜2010年 研究成果｜独立行政法人 理化学研究所. 独立行政法人理化学研究所（理研）基幹研究所 生化学シミュレーション研究チームの高橋恒一チームリーダーとオランダの原子分子物理研究所のピーターレイン・テンウォルデ教授らは、細胞内に存在する分子1つ1つの運動まで精密に再現する細胞シミュレーションの要素技術の開発に成功したと発表した。アメリカ科学アカデミー紀要『Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America: PNAS』2月9日号に掲載されるに先立ち、1月25日の週にオンライン掲載された。 新たな計算手法は「enha

[candidus]

そういう手法があったのか

[yrgnah_yats]

突っ込んだ内容。

[heis101]

「分子を少しずつ動かすのではなく、ある分子がほかの分子に邪魔されることなく自由に動ける範囲「保護領域」を設定し、分子が保護領域に入って何秒後に抜け出るかを計算する」「計算量が大幅に減」

[errthrw]

「観察技術の急速な発展で、1分子単位のゆらぎや運動が生命機能に重要な役割を果たしていることが明らかになっていた。」というのもすごいことだ。

[mobanama]

力技。

[synonymous]

すごい時代だね。

[anhelo]

理研基幹研と蘭原子分子物理研、細胞内に存在する分子1つ1つの運動迄精密に再現する細胞シミュレーションの要素技術開発。このeGFRD法用いれば特定分子にターゲットを絞れば、在来のスーパーコンピュータでも細胞丸ご

[kenchan3]

基本MDだろうが、細胞一つ計算できるようになるとは。　でもE-Cellのネーミングがどうもねえ。

[petronius7]

これって分子動力学の一種だと思うんだけど、化学反応まで取り扱うってどういうことだ。

[terazzo]

衝突判定の効率化的な手法？

[shat]

これすごい。。

[kmiura]

これは使いたいなあ。でもスパコンじゃないとだめなのか。GPUに実装してくれ。

[imo758]

弾幕シューティングのプログラムとかでとっくに使われてそうな技術だけど、なんで適用されてなかったんだろう。ひょっとすると真のブレークスルーは全く別のところで、この説明はカモフラージュなんじゃ…。