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SHIROKANE SCSHIROKANE, the supercomputer at Human Genome Center ヒトゲノム解析センターのスーパーコンピュータシステム SHIROKANE は、主に 2022 年 4 月から運用を開始した Shirokane6 と 2024 年 4 月から運用を開始した Shirokane7 で構成される、ライフサイエンス分野では国内最大の計算機システムです。学内外と高速ネットワークで接続された計算ノード Thin、計算ノード Fat、計算ノード GPU、ホームディスク、アーカイブディスクなどを擁し、多様なゲノム研究環境を提供しています。 学術機関だけでなく、民間機関からの利用申請も受け付けています。 システムの構成SHIROKANE 全体構成 対象者ゲノム研究を通じてライフサイエンス分野の振興を促進し、国民の健康医療の向上および教育に供するこ
ここでは、スパコン Wiki から抜粋して AGE の利用方法を紹介します。 目次Altair Grid Engine (AGE) とはAGE とは 基本的な利用法AGE の基本的な利用方法qstat コマンドの状態表示の意味ジョブスクリプトジョブ実行開始のユーザ間の優先順位qstat コマンド実行時の state 列の意味高度な利用法、キューの設定SHIROKANE の AGE のキューの設定SHIROKANE の AGE のリソース設定複数の CPU コアを使用するジョブ様々な AGE の利用手法自分自身の AGE の利用状況qmon の利用参考情報 SHIROKANE Tutorial 資料と動画 (SHIROKANE のアカウントが必要です)
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