Pymetamapで英語電子カルテからUMLS conceptを抽出する - radiology-nlp’s blog

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Pymetamapで英語電子カルテからUMLS conceptを抽出する - radiology-nlp’s blog

はじめに NIHが提供しているMetamapというツールを使うと英語テキストから病名，薬剤名，解剖学的部位な... はじめに NIHが提供しているMetamapというツールを使うと英語テキストから病名，薬剤名，解剖学的部位などを抽出することができます． metamap.nlm.nih.gov Metamapは本来Javaで書かれており，Pythonでデータ分析をする際に扱いづらかったのですが，世の中には親切な方がいるもので，PymetamapというPythonラッパーが作られていました．そこで今回はPymetamapを使って英語電子カルテから病名抽出を行いたいと思います．動作環境 Python v3.6.4 nltk v3.6.2 準備 Metamapはすでにインストールされているものとします．詳しくはこちらを参照してください． radiology-nlp.hatena blog.com PymetamapはこちらのGitHubリポジトリをCloneして入手します． github.com cd ~

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yag_ays2021/05/02

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