本当に生物は良くできているのか - 教養学部報 - 教養学部報

市橋伯一 本当に生物は良くできているのか 市橋伯一 生物のしくみは良くできていると一般的には言われています。確かに、脳の仕組みも、眼の仕組みも驚くほど精巧で、時に人工物よりも高性能を発揮します。そしてそれは細胞の中身にも当てはまります。最小の単細胞生物は光学顕微鏡でギリギリ見えるくらいの大きさですが、その中で千種類を超えるタンパク質がひしめきあって数百の化学反応を制御しています。こんなものは人間には未だ作ることはできず、神がデザインしたと信じたくなるのも理解はできます。 しかし、こうした良くできたしくみであっても、見方を変えると、意外に出来の悪いところも目につくようになります。私は、合成生物学といって、生物のしくみを試験管内で再構成する研究をしています。作ってみようとすると、生物のやり方はやたらまだるっこしくて、「自分が神様ならもっと上手くデザインするのに」と思うこともしばしばです。今年度

[frantic87]

技術的負債のようなものが生物に残っているのではと思うことはある

[dynamicsoar]

この文で『歴史的経緯』と書いているものは系統的制約 (phylogenetic constraints) という進化における重要な考慮事項のひとつ。でも、それ込みでもやっぱスゴイわ、ってのも多いよ

[turanukimaru]

淘汰圧に関係のない性質は淘汰されず残る。日本人の成人が牛乳を飲むとおなかを壊すのは良くできているのでもなく不具合でもなく単に淘汰されなかっただけ。細胞内のことも十分に動けばそれでいい。

[satotaka99]

神の領域に踏み込む思い上がった人類味があって好き

[thirty206]

肛門のガードがかなり緩いのは問題。

[tekitou-manga]

生物の世界も「とりあえず動くから」という部品の組み合わせで出来てるのかも？

[erya]

これだけ長い期間運用してて、リファクタリングしてないのにスパゲッティコードみたいになってないのすごくね？

[wildhog]

行き当たりばったりで最適化されている感じはある。デザインされた訳ではなく突然変異の積み重ねだから35億年間継ぎ足されて機能拡張されてきたレガシーコードの塊みたいなものなのだろう

[gorokumi]

不要に見える箇所は、まだ人間がその有用性を発見できてないだけでは

[operator]

リファクタリングできないから。動かしながらちょっとずつ変更してるからだろうなぁ。鉄道運行を止めずに駅の建て替え工事をすると大変なことになるのと一緒ですね。横浜駅、おまえのことだよ！

[rjj]

“本論文で私たちは、必要最低限の二十一種類（翻訳開始用に＋１されています）のｔＲＮＡをＤＮＡ上に隙間なく綺麗に並べて、一種類の切断酵素だけを使って全部一気に作ってみました”

[nuara]

進化システムがよくできている。しかし、そのシステムには目的がない。

[bellonieta]

「生物はよくできている」って言って思考停止してる人が多いよね、と読んだ

[takahiro_kihara]

"進化というしくみは近視眼的な最適化が得意"

[ka-ka_xyz]

「先に完成形がある上で最適な設計」ならまあそうなんだけど、「サイコロとピタゴラスイッチの組み合わせで何かうまく動くようになる」という点で言えば本当によく出来ている。

[i_ko10mi]

精錬されてない部分や無駄も含め総合的に良くできていると思う。人間がスパコンやAIをデザインするように、プログラムして進化の方向を見守ってる存在（神とか創造主と呼ばれる）も居ると思ってる。

[ite]

神「多分動くと思うからリリースしようぜ」 ……実際動かなかったら死ぬだけだし、一個体の生死にこだわるのは我々が矮小な一個体だからなので雑なところはたくさんあるだろうな。最適解を探すには計算量が足りない

[shikiarai]

そらもうツギハギよ。生態系もツギハギだし

[misozui]

すべての細胞に全ゲノム情報を持たせるのは、必要ないし、セキュリティ上の問題になるんじゃないかと考えてしまうが、そう考えるのも人間の浅はかさなんだろうという気もする

[sin4xe1]

メンテナンス期間がものすごいからねぇ

[baseb]

http://nsgene-lab.jp/expression/genetic_code/ tRNAコドン64パターンのうち、セリン・アルギニンに対応するパターンが6つずつもあるのに、メチオニンは1つしかなく、しかも開始コドンと被っている

[uzusayuu]

だいたい、DNAに刻み込まれてる情報が、タンパク質の作り方、だもんなあ。そこから複雑な体ができあがることが信じられない。

[ringopower]

その場の最適化をすると簡単に絶滅するからとにかく多様な可能性を残すんだよな

[deztecjp]

生物の進化をたどると、そこそこうまくいっている部分については抜本的な改良が行われないことがわかる。「一時的に従来より不出来な状態に耐える」ということができない。後脚の逆膝問題など。

[qouroquis]

生物の設計ミスといえば、食道と気管が一部共用なこと（誤嚥による事故がなくならない）とかが思い浮かぶけど、細胞内の化学反応レベルでもあるのか。

[misomico]

心臓、眼、神経とかはすごく技術的負債を感じる。コピペと改変で作るから謎のおまけがつくことはある

[mutinomuti]

メタン作るのにオナラじゃなくて石油化学でええんやでって言ってるようなもん(´･_･`)

[kamezo]

「すごくよく考えられてる」みたいに思える機構もあるけど、「なんでこうなってるんや」もけっこうあるよね。さらに何万世代も続けば洗練されていくんですかね。その前に太陽系の寿命が来るかな。56億7千万年後……

[moandsa]

遺伝子そのものは生物と全然違う動きしてるように思える。

[ku__ra__ge]

火星とかエウロパとかで将来見つかるであろう生物が、こういう根本的な部分の「最良ではない仕組み」を共有してるかどうかは（太陽系内）ハンスペルミア説が成立するかを見分ける材料にできそう。

[sugi1120]

盲腸とか憩室とか要らないパーツ割とあるし、気道と食道が別系統になってないのもイケてないと思うんだよな〜

[grankoyan2]

各々見たら粗はあるんだろうけど、再現性というか自己複製機能・生殖がえぐい

[lbtmplz]

時間を主成分に使用する一種の演算装置..

[dltlt]

なにかのフラグに聞こえてしまうが

[kyukyunyorituryo]

DNAで意味のないのが多いと思われていた（ジャンクDNA）が実際には重要な機能を持っている事が後でわかった例もある。

[evans7]

医学を学ぶと分かるが人間の体はかなり不安定。元からあまり良くできてないがその上たったの200年ぐらいの間に寿命が飛躍的に伸び更に問題が頻発するようになってる。進化の過程で戻せない失敗を多数含むからですね。

[rrringress]

ハンディキャップ理論もあるし

[WolfgangMittwoch]

外部環境への適応が遺伝の進化スピードでは間に合わないために、脳が発達したという仮説を養老孟司さんが述べていたことを思い出した。

[eos2323]

過去の環境に対する最適化を引き継いでいるわけなので、現環境では不要という機能もあるだろう。NPUやTPU、GPUが増えてもCPUの各種機能が維持されるように。

[panda_q]

胎内の赤ちゃんはまず爬虫類の脳を作り人間に進化させてから産まれる。生物は進化の歴史を踏んでるから非効率。試行錯誤し結果その手順になった。人間はそれを観察し導く答えを知ってるから計算手順を最適化できる