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ブックマーク / www.riken.go.jp (1)

  • プライマーのTm値

    ようこそ。Tm値の計算のところへ。 オリゴヌクレオチドのTm値の推定には微妙に違う色々な式があります。ここでは、"Current Protocols in Melecular Biology"に準拠した式で行ないます。 Tm(℃)=81.5+16.6*log[S]+0.41*(%GC)-(500/n) ...(1)   [S]   :塩のモル数    (%GC) :オリゴヌクレオチド中のGC含量(%)   n    :オリゴヌクレオチドの長さ(pb) 塩濃度[S]は通常Na+イオンのモル濃度を差すがPCR反応液の場合次のルールで計算する。   1)K+イオンはそのまま加算する。   2)Trisイオンは0.65倍して加算する。   3)Mg2+イオンは計算に入れない。 以下の表にあげた標準的なPCRバッファーの塩濃度は   50mM KCl   10mM

    kazafumi
    kazafumi 2005/12/26
    プライマーのTm値計算。
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