「RDKitによる3次元構造の生成」という記事でJupyterノートブック上で化合物の3次元構造を表示するにはpy3Dmolというライブラリを利用するのが広く使われるようになってきていると述べました.実際にpythonのケモインフォマティクス用ライブラリであるrdkitのIPythonConsoleモジュールでも立体構造の表示の際には内部でpy3Dmolをimportして使っていることも説明しました. 今回はpy3Dmolに関して,そもそもどういったライブラリなのかの説明から始めて,詳しい使い方を解説していきたいと思います.是非とも使い方をマスターして美しい立体構造を堪能してください.