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RDKitに関するp_tanのブックマーク (1)

  • Google ColabでRDKit:ケモインフォマティクス用のpython環境を手軽に構築

    このようにColabでは標準で非常に多くのライブラリが用意されており,すぐに作業に取り掛かることが可能となっています.しかし,ケモインフォマティクス用のツールなど専門性の高いものは準備されていませんので各自でインストールする必要があります. 例えば「化合物データベースPubChempythonで使いこなす」という記事で解説しているpubchempyをpipを用いてインストールしてみましょう. !pip install pubchempy RDKitのインストールとimport 「RDKitでケモインフォマティクスに入門」という記事でも説明したように,2022年時点ではpip,condaのいずれを用いてもrdkitをインストールすることが可能です. Colab上にconda環境を準備するのはやや面倒ですので,「計算化学にpythonとpsi4で入門」という記事で説明している量子化学計算用ラ

    Google ColabでRDKit:ケモインフォマティクス用のpython環境を手軽に構築
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