1939年2月5日(日本26聖人の殉教記念日)、日本のキリシタン宣教史、および、宣教に伴う日欧文化の交流を研究するとともに、その知識と成果を広く普及することを目的とし、故ヨハネス・ラウレス師によって設立された。 学際的視野から国内外のキリシタン学関係史資料の蒐集、研究、出版などの事業を行ない、その成果を公表して本大学における教育と研究に役立てると同時に、キリシタン学に関する専門図書館として広く学界に貢献している。 また、キリシタン文化研究会(学会)の運営を担当し、当会主催の文化講演会(毎年、12月第一日曜日)を行なっている。今年度は、2008年12月7日(日)に開催する。 現在は科学研究費補助金を得て、ラウレス編『吉利支丹文庫』(文献目録)の第三版を、インターネット版(ラウレスキリシタン文庫データベース)として世界に向けて公表している。