RNA-Seqの続きを書く予定でしたが、ちょっと寄り道して、別なことを。 只今、CBI学会(Chem-Bio Informatics学会)に来ています。 日立ソリューションズのブース&プレゼンで、面白い技術を見つけました。 Optical Mapping というものです。 アメリカでは数年前から導入されていたようですが、このたびマシーンが完成して日本では初めて発表されました。 その名も「全ゲノムソリューション」 外挿遺伝子やリピート領域の同定、ゲノム構造の解析、高精度な菌株同一性に威力を発揮するといいます。 OpGEN 社のテクノロジーは、簡単に言うと全ゲノムレベルで制限酵素のマップを作ることにあります。 測定原理は、 菌体から長い(200kb以上必要だそうです)ゲノムDNAを抽出し ガラス基板上に並べて固定し、 制限酵素(1種類)でDNAを切断し 蛍光により切断断片の長さを測定 制限酵素