はじめに 配属された lab で、実際にデータを触って解析をし始めた。 今まではなんでも python でコードを書いて、可視化していたのだが、どうも毎回 python hogehoge.py と実行するのが面倒すぎる。 わざわざ python コードを書くのも嫌だし、ファイルが増えるのも嫌だと思うようになってしまった。 linux コマンドだけで片付くのであれば、それに越したことはない。 そんな中で出会ったのが datamash である。 本記事では datamash でできることとできないことを紹介し、できないことについてはその打開策を紹介する。 datamash について 公式サイトはこちら。 www.gnu.org install 方法はシンプルなので、それぞれお願いします。 僕の場合はスパコンに元々入っていたので、この工程は飛ばします。 datamash でできること できること
![datamash や awk を用いた Linux での簡単なデータ分析 - 東大 生物情報学科、学部生の備忘録](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/b3b1ccd3d7faa541d5996de4218cc9e985dded4e/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fcdn-ak.f.st-hatena.com%2Fimages%2Ffotolife%2Fu%2Fut-bioinformatic%2F20230819%2F20230819231537.png)