FASTAとBLASTについて
NCBIでは、BLASTというFASTAのほぼ50倍速い、ホモロジー検索サービスが提供されます。これは、電子メールによるサーバーで、e-mailで検索配列を送るとe-mailで結果がもらえるというものです。また、これらのクローンサービスマシンが日本にも置かれるようです。 さて、BLASTは、Basic Local Alignment Search Toolの略で、NCBIにはBLASTのコーディングをしたWarren Gishがいます。以下のFASTAとBLASTの違いの話は彼に聞いた話です。 （註）現在、遺伝研（DDBJ）では、FASTA のサービスは Web、E-mail では提供しておりません（検索・解析サービスの一部終了のお知らせ）。FASTA をご利用の場合には、遺伝研スーパーコンピュータシステムをご利用ください。 遺伝研では現在FASTAというホモロジーサーチのプログラムが動い
研究に関するリンク
◎データベース PubMed Google Scholar Googleが提供する学術論文検索エンジン。PubMedと違い，全文検索なのでMaterials and Methodsまで検索対象になっており，非常に便利。また，PubMedに登録されていない論文もこちらなら引っかかることが多い。詳細については「研究留学ネット」内のコンピュータ情報の項を参照。 Web of Science（学内限定） 引用文献データベース。詳細については「研究留学ネット」内のコンピュータ情報の項を参照。 SciFinder Scholar（学内限定） 文献情報データベース。専用ソフトをインストールして使用する。 岡山大学附属図書館 岡山大学で見られない論文や本は，学外の図書館から文献複写や取り寄せができることを意外と周りの子達は知らないみたい。積極的に利用するといいと思う。 岡山理科大学図書館 岡大の図書館にな
検索結果で有利になる知られざるHTMLタグ5種類 - GIGAZINE
よく知られているように現在のウェブ検索のメインストリームをしめるロボット型検索は、回収したページのHTMLタグを解釈して意味を与え、重要度を判定し、検索結果に反映させます。 例えばタイトルに使われるH1などのタグはより重要な文字列と見なしますし、リンクタグに「rel=nofollow」が入っていればページランクなどの計算でポイント付与評価を無視するようになります。 しかしそれ以外にも数々のSEO業者が調べたり実験してきた結果、より有効に解釈されると判断されるがあまり知られていない5種類のタグが存在します。 以下がその5つのタグです。 SEOmoz Blog | 5 HTML elements you probably never use (but perhaps should) 1.addressタグ 住所、電話番号などの連絡先を示すためのものです。電子メールアドレスやメッセンジャーの情報
今日から国際灯台ウィークエンド
海の安全を見守り、航海の道しるべともなる灯台。その歴史と重要性を称え、毎年 8 月の第 3 週末に「国際灯台ウィークエンド」が開催されます。1998 年にスコットランドのアマチュア無線愛好家たちによって始められ、現在では 40 カ国以上が参加する大規模なイベントとなっています…
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文字列の検索 その3：書式と特殊文字の検索―MS Wordを利用した文字列の検索と置換―
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