人間の体内に暮らす細菌のゲノムのDNA配列を一挙に解析したところ、お互いに影響を与えながら生きる有機体としての人間と細菌の姿が明らかになってきた。 1. 集団で暮らす細菌 地球を見渡すと、上空8000mから地中5000m、そして水深約11000mの海底火山付近まで、ありとあらゆるところに細菌が暮らしている。細菌は地球上でもっとも多種多様で多数を占める生物種であり、時に、「地球は微生物の惑星」とも呼ばれる。私たちの身体でも、皮膚や口腔、腸内などに細菌が見られ、腸内には約100兆個、重さにしておよそ1kgもの細菌が少なくとも数百種類常在している。これら、環境中の細菌の99%以上は、単離培養できないと言われている。通常、自然界の細菌は他の細菌と集団(叢)を形成して生息しているため、細菌同士や周りの環境との間の相互作用をする複雑で多様な生命システムをもち、単離培養の条件設定が難しいのである。 しか