エントリーの編集
エントリーの編集は全ユーザーに共通の機能です。
必ずガイドラインを一読の上ご利用ください。
small RNAをアノテートする ShortStack - macでインフォマティクス
記事へのコメント0件
- 注目コメント
- 新着コメント
このエントリーにコメントしてみましょう。
注目コメント算出アルゴリズムの一部にLINEヤフー株式会社の「建設的コメント順位付けモデルAPI」を使用しています
- バナー広告なし
- ミュート機能あり
- ダークモード搭載
関連記事
small RNAをアノテートする ShortStack - macでインフォマティクス
ShortStackはsmall RNA seqのデータをリファレンスゲノムにアライメントし、small RNAのlociをアノテー... ShortStackはsmall RNA seqのデータをリファレンスゲノムにアライメントし、small RNAのlociをアノテートするツール。改良が続けられており、2報目の論文では、高速化の他、複数のシーケンスデータの入力、bowtieによるアライメントなどに対応した。 テストデータ https://psu.app.box.com/v/axtelldata/ インストール 依存 samtools (version 1.x or higher) bowtie (if aligning) bowtie-build (if aligning and .ebwt indices not found) gzip (if aligning) RNAfold (unless running with --nohp option to disable MIRNA search) gzipはmacに標準