タイプ株のゲノムデータベース gcType - macでインフォマティクス

微生物は世界で最も豊富な生物と言われている。原核生物細胞は地球上に約4〜6×10^30個存在し、350〜550×10^15gの炭素を含むバイオマスを構成していると推定されている(1)。原核生物の総数は10^9種にも及ぶ(2)。1980年には、約1800種の細菌・古細菌の種名が承認された細菌名リストに掲載された(3)。その後、原著論文やInternational Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM)の「Validation List」に掲載された名前が検証されてきた。2020年9月現在、この数は16,763件に増加している。 原核生物種の記述では、そのタイプストレインを指定する必要があり、その表現型や遺伝子型はよく特徴づけられて記述されていることが多い。タイプストレインから得られた16S rRNA遺伝子および全