【minimize入門】SEIRモデルでデータ解析する♬ - Qiita

COVID-19のデータ解析する準備として、以下のグラフを出力するまでの解説をする。 この図は、与えられたdataに対して感染症のSEIRモデルにminimize@scipyを利用してフィッティングした図である。 手法は、ほぼ以下の参考のとおりです。どちらもいろいろな意味で参考になりました。 【参考】 ①感染症数理モデル事始め PythonによるSEIRモデルの概要とパラメータ推定入門 ②感染病の数学予測モデル (SIRモデル）：事例紹介(1) ③SEIRモデルで新型コロナウイルスの挙動を予測してみた。 やったこと ・コード解説 ・SIRモデルとSEIRモデルでフィッティングしてみる ・その他のモデル ・コード解説 コード全体は以下に置いた。 ・collective_particles/minimize_params.py 解説は上記の参考に譲り、ここでは今回利用したコードの解説をする。な