Pythonで作るVolcano plot - Qiita

Volcano plotとは Volcano plotは、RNA-seqやマイクロアレイで二群の遺伝子発現量を比較する際に、遺伝子の発現比と統計的有意性（p値）でプロットした図です。 x軸を発現比、y軸を統計的有意性としたときのプロットが一般的な描き方です。 何千、何万という遺伝子の発現を視覚化して、重要な変化をしている遺伝子を特定することができます。 この図だと赤が統計的有意に発現量が増加した遺伝子で、青が統計的優位に発現量が減少した遺伝子を示しています。 エクセルでも作れますが、Pythonでbioinfokitライブラリを使えば、めっちゃ簡単に、しかもかっこいい図が作れちゃいます。 今回はこのVolcano plotの作り方を記していきます！ ライブラリのインストール pipでもcondaでもインストールできますが、今回はcondaインストールをやっていきます。 下のコマンドを実行し