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論文と公共データベースを使って無料で始めるAI創薬 - Qiita
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論文と公共データベースを使って無料で始めるAI創薬 - Qiita
1. はじめに コンピュータ上で化合物の活性や物性を予測することは従来より行われてきたが、特に近年、... 1. はじめに コンピュータ上で化合物の活性や物性を予測することは従来より行われてきたが、特に近年、蓄積データの増大や、Deep Learning技術の発展もあり、AI創薬というキーワードを耳にするようになってきた。 そこで今回、新型コロナウィルス(SARS-CoV-2)の治療薬の予測に関する "Computational Models Identify Several FDA Approved or Experimental Drugs as Putative Agents Against SARS-CoV-2" という論文の内容を自分で試してみることで、AI創薬を**「無料で」**疑似体験してみたので共有したい。 この論文を選んだのは、以下3つの理由による。 公共データを利用しており、解析手順、プログラムがgithubで公開されているため、再現しやすい。 従来型の解析手法(フィンガープ