フィンガープリントを可視化してみる～AtomPairFingerprint～ - Qiita

はじめに フィンガープリントを使って予測モデルを作成した場合、説明変数として利用されたフィンガープリントのビットがどういうものか分からないと、予測のメカニズムの理解が難しいだろう。 Morganフィンガープリントについては、参考文献に示したようにビットを可視化するための情報がいくつかある. 今回は、情報が少ない AtomPairFingerprint についての可視化方法を検討したので共有したい。 AtomPairFingerprintとは？ AtomPairFingerprintとは、簡単に言うと分子内における原子のペアの出現に関するフィンガープリントだ。もう少し詳しく言うと、C原子とN原子が同時に出現したというような単純なものではなく、同じC原子であっても結合の違いを考慮したり、同じペアであってもペア同士の距離の違いを考慮したりしている。 詳しくは、アトムペアやドナーアクセプターペアフ