IGVをソケット通信をつかって操作する方法、および、その方法を利用してRubyのGemを作った話 - Qiita

はじめに IGVはゲノムブラウザと呼ばれるソフトウェアです。アライメントされたリードのbamファイルや、ゲノム上の位置情報にアノテーションを加えたbedファイル、遺伝子情報の書かれたgff3ファイルなどさまざまなファイルを閲覧することができます。bioinformaticsに関わったことがある方は、このソフトをご存知の方が多いのではないでしょうか。 GithubのIGVのリポジトリ ※画像はIGVのホームページより そんなIGVですが、マウスでクリックしながら操作すると少し手間がかかることがあります。 リファレンスゲノムを指定して 必要なファイルを読み込んで 注目している場所を一つずつみてまわって スクリーンショットをとって画像として保存する 目視で結果を確認することは楽しいことでもあり、とても大事な作業だと思いますが、一方で定型的な作業はなるべく自動化していきたいという気持ちもあると思い