goatoolsによるGO解析方法まとめ - Qiita

概要 GO(Gene Ontology)は、さまざまな生物の遺伝子(がコードするタンパク質)の機能に関する情報を統一化された語彙により表現したもの。 生物医学研究をする上でGOは重要な役割を果たしており、オミックス(ゲノミクス・トランスクリプトミクス・プロテオミクス・メタボロミクス等の総称)実験にて、生物の構造・機能・ダイナミクスを解明するため、一般的によく利用される。 本記事では、PythonのGO解析ツールである「goatools」を利用して、特定コントロール実験条件下での発現変動遺伝子のような遺伝子データセットにおいて統計的有意に多く含まれる機能情報を発見する手法である「GOenrichment解析」や「GOデータ可視化」について記載する。 実行環境設定 下記pipコマンドにより、goatoolsインストール pip install goatools GOデータの可視化を行う場合は、