funannotateをsingularityで動かす - Qiita

はじめに 以前書いた funannotateを遺伝研スパコンで動かす という記事の続きです. condaでインストールするとめちゃくちゃ面倒だったので、DockerHubで配布されているdockerイメージをsingularityイメージに変換して、遺伝研スパコンで使えるかどうか試してみました. Singularityを使うメリットとデメリット メリット インストールが楽 $HOMEを自動でマウントしてくれる ヘルプメッセージを確認する程度ならインタラクティブノード（qloginで入れるノード）で実行可能 最新版をcatch upできる デメリット 作者さんのGitHubで配布されているfunannotate-dockerという簡単実行スクリプトが（そのままでは）使えない やりかた ゲートウェイノードにログインしてから, $ qlogin -l mem_req=20G,s_vmem=20G