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funannotateをsingularityで動かす - Qiita
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funannotateをsingularityで動かす - Qiita
はじめに 以前書いた funannotateを遺伝研スパコンで動かす という記事の続きです. condaでインストール... はじめに 以前書いた funannotateを遺伝研スパコンで動かす という記事の続きです. condaでインストールするとめちゃくちゃ面倒だったので、DockerHubで配布されているdockerイメージをsingularityイメージに変換して、遺伝研スパコンで使えるかどうか試してみました. Singularityを使うメリットとデメリット メリット インストールが楽 $HOMEを自動でマウントしてくれる ヘルプメッセージを確認する程度ならインタラクティブノード(qloginで入れるノード)で実行可能 最新版をcatch upできる デメリット 作者さんのGitHubで配布されているfunannotate-dockerという簡単実行スクリプトが(そのままでは)使えない やりかた ゲートウェイノードにログインしてから, $ qlogin -l mem_req=20G,s_vmem=20G