DICOMデータの取り扱い～匿名化から臨床導入まで～ - Qiita

はじめに 本記事では、医療画像を用いた研究を行う方、自作した深層学習モデルを臨床に導入しようと考えている方、あるいはコンペティションでDICOMデータを取り扱う必要のある方向けに、病院内ネットワークからDICOMデータを取り出すための匿名化処理から、深層学習モデルの予測などをDICOM形式で出力する方法まで、DICOMデータをpythonで扱うにあたって必要になるであろう情報に絞って紹介していきます。 特に後半部分では、CT画像と、その輪郭データ(RT Structure)について扱いますが、他モダリティについても応用できる部分が多いかと思います。 正しい情報の記述を心がけますが、間違いに気づかれた方はコメントで教えていただけますと幸いです。 前提知識： Python DICOMとはなんぞや 目次 pydicomを使おう 匿名化をしよう 画像データを出力しよう テーブルデータを出力しよう