コーフェン相関係数を用いて、階層的クラスタリングにおける最適な距離と方法を考える。 - Qiita

はじめに 階層的クラスタリングを行うときに迷うのが、どの距離と方法を使うのがよいのかという点です。正解の用意されていないクラスタリングでは、特にです。 今回は、距離と方法ごとにコーフェン相関係数を計算して、クラスタリングの妥当性を調べてみます。この値が１に近いほど良いとされています。（詳しくはこちら） データの準備 今回は、irisのデータセットを使いました。 # irisのデータセットを得る。 from sklearn import datasets dataset = datasets.load_iris() dataset_data = dataset.data dataset_target = dataset.target target_names = dataset.target_names dataset_labels = target_names[dataset_target