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2次元に3次元情報 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ
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2次元に3次元情報 - ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ
主成分分析で個人間の遺伝的遠近関係を評価し、それをプロットすることがある。主要2軸で十分に表現で... 主成分分析で個人間の遺伝的遠近関係を評価し、それをプロットすることがある。主要2軸で十分に表現できることもあるが、それだけだとよく分からないこともある。 そんなときには、3軸が作る3つの2次元プロットを見較べるのも手であるが、3軸目の情報を色で表すことも便利かも知れない。 今、第1、第2、第3に3軸の値の入った、タブ区切りの3カラムファイル"data.txt"があるとする。 0.0163 0.0191 0 0.0167 0.019 -0.0001 0.0164 0.0194 0.0023 0.0161 0.0193 -0.0032 0.0163 0.0191 0.0003 0.0162 0.0197 -0.001 0.0167 0.0191 -0.001 0.0162 0.0186 0.0006 0.0159 0.0195 0.0001 0.0161 0.0192 -0.0007 0.01