Instruction of chemoinformatics ケモインフォマティクスのオンライン入門書。
![Gaussian Process | Instruction of chemoinformatics by funatsu-lab](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/7071b5a6ab87381771e32030fcebf4a960acb0db/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Ffunatsu-lab.github.io%2Fopen-course-ware%2F%2Fpages%2Fmachine-learning%2Fgaussian-process-test-function.png)
SSII2020 技術動向解説セッション SS1 6/11 (木) 14:00~14:30 メイン会場 (vimeo + sli.do) グラフ構造をもつデータに対する DNN、すなわち Graph Neural Networks (GNNs) の研究はこの2、3年で参加する研究者が急増している。現状、様々なアーキテクチャの GNN が様々なドメインや様々なタスクで個別に提案され、概観を捉えるのも簡単ではない状態になっている。本チュートリアルは、広範に散らばった GNN 研究の現状についての概観と基盤技術を紹介するとともに、時間が許す範囲でコンピュータビジョン領域における応用例の紹介にも取り組みたい。
CHANGE-MAKERS読者のみなさま。 いつもCHANGE-MAKERSをご愛顧いただきありがとうございます。 CHANGE-MAKERSがCHANGEします 長い間ご愛顧をいただきましたCHANGE-MAKERSですが、この度、ちょこっとCHANGEすることになりました。 いままで掲載していた1000ページ以上の記事達を整理して、気持ちを新たに再出発です。 より身軽に再出発するために、過去のコンテンツ等については、以下のようにいたしました。 旧かった記事: 思い切って断捨離しました。 ソフトレイヤー活用ガイド: これを期に日本IBMのサイトへ旅立たれましたので、ぜひご活用ください。 ご登録いただいたメールアドレス: 当面はメール配信を予定していませんので、すべて廃棄させていただきました。 それでは、これからも引き続きどうぞよろしくお願い申しあげます。 CHANGE-MAKERS編集部
Function draws from a dropout neural network. This new visualisation technique depicts the distribution over functions rather than the predictive distribution (see demo below). So I finally submitted my PhD thesis (given below). In it I organised the already published results on how to obtain uncertainty in deep learning, and collected lots of bits and pieces of new research I had lying around (wh
DeepPose: Human Pose Estimation via Deep Neural Networks http://www.cv-foundation.org/openaccess/content_cvpr_2014/papers/Toshev_DeepPose_Human_Pose_2014_CVPR_paper.pdf 関連研究 人体をlocalなパーツが連結したものと見る手法 Figure Drawing Pictorial Structures Mixtures of Parts 人体をパーツに分けずholisticに推定する手法 DeepPoseはこちら 手法 モデルの構造はAlexNetを流用 入力:画像(220x220) 出力:各関節ごとの位置(2次元) loss 関節ごとの予測位置と真の位置のL2距離の和 上記ネットワークを直列につなぎ多段stage化する。後ろ
誰向け 深層学習をすでに理解して画像の分類から物体検出への仕組みをマスターしたい方へ 数式が多いのでコード確認したい方は下記へGo 具体的な実装例 おまけ Kerasに関する書籍を翻訳しました。画像識別、画像生成、自然言語処理、時系列予測、強化学習まで幅広くカバーしています。 直感 Deep Learning ―Python×Kerasでアイデアを形にするレシピ 目的 物体検出に関しての技術を体系的にまとめてコードベースまで理解したかったので書きました。 良書である画像認識の物体認識の章を参考にこの記事を作成しています。 画像認識 全体像 大きく分けて3つのフェーズに分かれます。 1: 物体領域候補の抽出 画像中から物体の領域候補を抽出する手法になります。精度と速度を左右する部分になります。図のように小ウインドウ(バウンディングボックス)を用意して一定の画素数ずらしながら領域候補を抽出する
TensorBoardの主要機能 折れ線グラフ 画像 音声 ヒストグラム 計算グラフ 次元削減のプロット TensorBoardの読み方 シンボルの意味 name scopeとnode グラフの色 Structure View Device View 計算時間・メモリ テンソルの次元数 Summary Operation scalar histogram image audio 可視化してみる ハイパーパラメータの探索 Embedding Visualization メタデータファイルの作り方 スプライト画像の作り方 ラベルによる色分け t-SNEとPCA まとめ TensorFlowの優れた機能として、TensorBoardによる充実した可視化環境が挙げられます。TensorBoardがあれば、ニューラルネットワークの学習が上手くいかないときに、俯瞰してネットワークを表示したり、様々なデ
Yahoo!がOSSとして開発している異常検知フレームワーク "EGADS" (Extensible Generic Anomaly Detection System) について書いた次の論文を読んだ: Generic and Scalable Framework for Automated Time-series Anomaly Detection (KDD 2015) リアルタイムなデータをモデリングする種のアルゴリズムの実装とはどうあるべきなのか、という話は難しい。 僕も異常検知や情報推薦のためのアルゴリズムをパッケージ化してみてはいるものの、 時系列データの入力、モデリング、予測、出力といったコンポーネントをいかに切り分けて実装するか バッチとオンラインアルゴリズムのバランスをいかに取るか どこまで自動化して、どこにヒューリスティクスを取り入れる余地を残すか といった点は本当に悩ま
Pythonには文字列やリストなど、長さをもつオブジェクトがあります。長さを手に入れるには、文字列なら、name.length ではなく len(name) のようにlen関数を使います。len関数はどうやってnameに入っているオブジェクトの長さを手に入れているのでしょうか。if文にはTrue/Falseとなる条件式を指定しますが、それだけでなく文字や数字、自分で作ったデータ型も渡せます。if文はどうやって与えられたオブジェクトがTrueなのかFalseなのかを手に入れているのでしょうか。 この発表では、Pythonのプログラムがどうやって必要な情報を手に入れているのか、また、自分で実装するときにどう実装すればlen()やif文やfor文に指定できるのかを説明します。 Read less
最終更新:2017年7月26日 機械学習法を用いた時系列データの予測方法について説明します。 R言語を使えば、機械学習も時系列データのデータ操作も簡単にできます。 両者を組み合わせて、時系列データへの予測モデルを作成してみました。 ソースコードはこちらに置いてあります。 スポンサードリンク 目次 解析の準備 機械学習とは 今回予測するデータ caretパッケージを使う準備 Rによる機械学習 予測モデルの概要 ハイパーパラメタのチューニング 機械学習による時系列予測 最適な次数を選ぶ 当てはめ精度の評価 将来の予測 1.解析の準備 機械学習とは 機械学習とは、次にどのようなデータが来るのかを、決まった手順を踏んで予測する技術、あるいは手法のことです。 機械学習の良いところは、予測のための「手順」を、過去のデータからほとんど自動で見つけられることです。 昔は人間が勘と経験そして度胸で予測を出し
Model ensembling is a very powerful technique to increase accuracy on a variety of ML tasks. In this article I will share my ensembling approaches for Kaggle Competitions. For the first part we look at creating ensembles from submission files. The second part will look at creating ensembles through stacked generalization/blending. I answer why ensembling reduces the generalization error. Finally I
こう言い換えろ→論文に死んでも書いてはいけない言葉30 読書猿Classic: between / beyond readers を書いたとき、「あとは穴埋めしたら論文を出力してるものが作れないか」みたいな話があったので、作ってみた。 何であれ、文章を書く骨法は、書きたいことではなく、書くべきことを(そしてそれだけを)書くことである。 問題は何を書くべきかであるが、幸いにして、論文については後述するようにほとんど決まっている。 結論から言えば、以下の表を埋めていくだけで、論文の骨組みができあがる。 必要な項目は揃い、しかるべき順序で並ぶ。 論文穴埋めシート こんな簡単な穴埋め表がこれまであまり取り上げられなかったのは、わざわざ作るまでもないことも勿論あるが、その他にも次のような理由がある。 つまり、こうした穴埋め表が、 あなたは論文が書けないのではない。 研究ができないのだ。 という目の当
はじめに 今までいろんな画像処理のプログラムを書いてきましたが、その多くで物体検出のアルゴリズムを使っています。 ご注文は機械学習ですか?・結城友奈はサンタであるなどの記事ではOpenCVでアニメ顔検出をやってみたで紹介したlbpcascade_animefaceを使いました。これは2001年のViolaとJonesの論文で提案された方法に1994年(くらい)に提案されたLBP特徴量を組み合わせた、2008年の論文の方法を応用したもの(多分)です。 友利奈緒判定botではdlibによるHOG特徴を用いた物体検出がすごいで紹介したHOG特徴量とSVMを組み合わせた方法を使っています。これは2005年の人検出に関する論文の方法を使ったものです。 どのプログラムでも物体検出した後の判定精度はそれなりに高いのに、物体検出の精度の低さが全体の完成度を下げている感じになってしまっていました。2005年
Algorithmic music composition has developed a lot in the last few years, but the idea has a long history. In some sense, the first automatic music came from nature: Chinese windchimes, ancient Greek wind-powered Aeolian harps, or the Japanese water instrument suikinkutsu. But in the 1700s automatic music became “algorithmic”: Musikalisches Würfelspiel, a game that generates short piano composition
iPS細胞研究基金は2009年の設置から10年以上が経ち、研究活動への資金援助や優秀な人材の確保など、iPS細胞研究を推進する大きな役割を果たしてきました。 iPS細胞研究所(CiRA)は日本のiPS細胞研究を先導する研究機関として、引き続き革新的な基礎研究と、多くの難病やケガを治療できる新しい医療の実用化を目指してまいります。 iPS細胞は、今後の医療に大きな影響を与え、誰もがその恩恵を受ける可能性のある新しい技術ですが、医療応用までには長い時間と多くの研究費を要します。一日も早い成果を目指しながらも、一歩一歩着実に進めてまいります。 皆様からのご支援は、次世代を担う優秀な研究者の積極的な登用や育成、知財の確保・維持の費用などに大切に使わせていただきます。 どうか、皆様のあたたかいご支援を賜りますよう、心よりお願い申し上げます。 領収証書の必要な方は、下記の方法で ご寄付のお手続きをお願
トピックモデルについての説明は,pythonでトピックモデルの最尤推定実装 に記載したので割愛します. 準備 必要な式を先に導出しておきます. ベータ関数 ディリクレ分布 ディリクレ分布に従う確率変数 ベータ関数 ベータ関数は以下のように表されます. \begin{align} \int_0^1 \phi^{\alpha - 1} (1 - \phi)^{\beta - 1} d\phi &= \left[ \cfrac{\phi^{\alpha}}{\alpha} (1 - \phi)^{\beta - 1} \right]_0^1 + \int_0^1 \cfrac{\phi^{\alpha}}{\alpha} (\beta - 1) (1 - \phi)^{\beta - 2} d\phi \\ &= \cfrac{\beta - 1}{\alpha} \int_0^1 \phi^{
CompanyEngineeringProductSunsetting AtomWe are archiving Atom and all projects under the Atom organization for an official sunset on December 15, 2022. January 30, 2023 Update: Update to the previous version of Atom before February 2 On December 7, 2022, GitHub detected unauthorized access to a set of repositories used in the planning and development of Atom. After a thorough investigation, we hav
おはようございます. 今回は教師あり学習モデルを題材に,入力データが欠損している場合のベイズ流の対処法を解説します.ベイズモデルというと,たいていの場合は事前分布の設定の仕方云々だとか,過学習を抑制できるだとかに議論が注目されがちですが,個人的には,パラメータや潜在変数を推論することとまったく同じ枠組みで欠損値も同時に推論できることが,実用上非常に便利なベイズの特性だと思っています. データの欠損部分の取扱い データに欠損部分が存在することはよくあります.センサーデータを解析する際は,ネットワークの状況やデバイスの不具合によってデータの一部が欠けた状態で上がってくることがあります.スマホから複数種類のデータを集めるといった状況を考えてみると,例えば加速度センサーの値は継続的に取得できたとしていても,GPSの位置情報はほとんど上がってこないといった場合もあるかと思います.また,何かしらのユー
ここ数ヶ月いろいろ資料を読んでいるのだが、どうにも腑に落ちない、というか、しっくりこないのが「Network in Network(NIN)」。 正直、何をしているのかよくわからない。 説明が分かりづらい。 ということで、理解できたところまでもまとめてみました。 勘違いしているところがあれば、指摘していただけるとありがたいです。 良くわからないこと まず見かけるのが、この図。 その内、この部分がNIN(の一要素と思われる)。 ここでの処理(畳み込み)が「Multilayer Perceptron Convolution(Mlpconv)」と呼ばれるらしい。 ちなみに最後の方は「Global Average Pooling(GAP)」で、こちらにまとめを書いてみたので、興味があれば参照してみてください。 で、このMlpconvで何をしているのかが分からない。 これは何なのか?→① これは何な
When we look very closely at images generated by neural networks, we often see a strange checkerboard pattern of artifacts. It’s more obvious in some cases than others, but a large fraction of recent models exhibit this behavior. Mysteriously, the checkerboard pattern tends to be most prominent in images with strong colors. What’s going on? Do neural networks hate bright colors? The actual cause o
概要 コマンドラインパーサとして、argparseと呼ばれるPythonの標準パッケージが存在するが、使い勝手がいまいちだと感じています(あくまで個人的な感想ですが…)。 今回は、たまたま見つけたclickと呼ばれるサードパーティ製のPythonパッケージを用いてコマンドラインの引数を解釈するコードを書いてみようと思います。 argparseと比較してclickの書き方だと、コードが書きやすく、あとから読み返しやすくなると感じます。 Clickのドキュメントはこちら。 http://click.pocoo.org/6/ 内容 すでに、こちらのブログに詳しく解説されているのでここでは忘備録的な記載に留めようと思います。 blog.amedama.jp インストール AnacondaもしくはBiocondaがインストールされていることが前提。 conda install click 基本的な使
Variational Auto Encoder nzw 2016 年 12 月 1 日 1 はじめに 深層学習における生成モデルとして Generative Adversarial Nets (GAN) と Variational Auto Encoder (VAE) [1] が主な手法として知られている.本資料では,VAE を紹介する.本資料は,提案論文 [1] とチュー トリアル資料 [2] をもとに作成した.おまけとして潜在表現が離散値を仮定したパターンと Keras による実験 結果をつけている.間違いなどがあれば指摘してほしい. 2 Variational Auto Encoder 2.1 導入 x z φ θ N 図 1 今回考えるグラフィカルモデル VAE では図 1 にあるような潜在変数を含んだグラフィカルモデルで表現される生成過程を考える.x は 1 つのデータで,i.
Semi-Supervised Learning with Deep Generative Models [arXiv:1406.5298] 概要 Semi-Supervised Learning with Deep Generative Models を読んだ Chainer 1.8で実装した モデルM1、M2、M1+M2の実装方法の解説 モデルM2で100ラベルのエラー率9%を達成した モデルM1+M2で100ラベルのエラー率4%を達成した はじめに Variational AutoEncoder(VAE)は、半教師あり学習に用いることのできるオートエンコーダです。 学習のベースとなる確率的勾配変分ベイズ(SGVB)については以前の記事をお読みください。 この論文では3つのVAEのモデル、M1、M2、M1+M2が提案されています。 M1 M1は教師なし学習のためのモデルです。 Chai
ユリウス暦2020/1/6更新: その後のこの分野の急速な発展のため, 情報を更新した ill-identified.hatenablog.com 概要 機械学習か経済学 (計量経済学) そのいずれかに関してある程度の知識がある人間向け もうすでにこのネタでブログその他がいくつも書かれたと思うがさらにダメ押し 実質的には, Mullainathan and Spiess (2017) のレビューと, 多クラス分類を例にしたデモンストレーション. 前半のレビューと後半のデモンストレーションは実はつながりがあまりないので独立して読むこともできる. エビデンスが弱いものの, 多クラス分類を利用する際に注意すべき点が示唆された. 今回も時間がないので若干手抜き気味 vs 計量経済学はモデルの説明を, 機械学習は予測の精度を求めるということは以前,[異種試合] ディープラーニングVSディープパラメー
キーワード: YRP野比, ヨコスカリサーチプリズン, デスマーチ, 軍曹 京浜急行を三崎口方面へ下っていくとYRP野比という変わった駅名がある。 アンサイクロペディアによると、YRPとはヨコスカ・リサーチ・プリズンの略称、直訳すると横須賀研究開発刑務所。 YRPでの労働環境はデスマーチの中のデスマーチと言われるほど過酷を極め、逃亡を図る者や過労死、うつ病での自殺者が絶えないと噂される。 ヨコスカリサーチプリズンでのデスマーチの惨劇を綴った有名な文章として、 2ちゃんねるのプログラマー板に投稿された『【軍曹が】携帯電話開発の現状【語る】』というものがあります。 この物語は[笑わないプログラマ]というサイトが取り上げて世に広まりましたが、既にリンク切れとなってしまっています。 いくつかのブログがコピペを保管していますが、いずれもほとんど更新がなされていない古いもので、いつ消えてしまうかわかり
プラットフォームの概要 AI Platform 生成 AIおよび予測 AIのプラットフォーム もっと詳しく ドキュメント 新機能 ログイン 無料で始める 運用 自信を持ってAIを拡張し、比類のないエンタープライズ・モニタリングとコントロールでビジネス価値を促進 デプロイと実行 再学習と最適化 監視と介入 ガバナンス AIの環境、チーム、およびワークフローを統合し、大規模な範囲での完全な可視性と監視を実現 レジストリと管理 監査と承認 コンプライアンスドキュメント生成 構築 ニーズの進化に合わせて自由に適応できるオープンなAIエコシステムで、迅速なイノベーションを実現 分析と変換 学習とチューニング 組立てと比較 プラットフォーム統合 インフラストラクチャーへのデプロイ ソリューション 業界ごと ヘルスケア 製造 小売業 金融サービス 成果ごと ユースケースのライブラリー お客様事例 Dat
リリース、障害情報などのサービスのお知らせ
最新の人気エントリーの配信
j次のブックマーク
k前のブックマーク
lあとで読む
eコメント一覧を開く
oページを開く