福永 津嵩 @fukunagaTsu 慶應義塾大学理工学部生命情報学科准教授。ゲノム配列解析/RNA構造解析/オミクスデータ解析に関連するバイオインフォマティクスの研究を行っています。つぶやきは個人としての発言であり、所属組織が関与するものではありません。 sites.google.com/site/fukunagat…
こんにちは、Insight EdgeのLead Engineerの日下です。 今回は、DEAPライブラリを利用した遺伝的アルゴリズムをAWS Lambdaで分散並列実行した話を紹介しようと思います。 目次 目次 背景と課題 並列化の方法の検討 どこを並列化するか? どのように並列化するか? 実装の方針 呼び出し側コード Lambda側コード その他 Lambdaを呼び出すためのDEAPへのmap実装 呼び出し側コード Lambda側コード 今回の実装の工夫ポイント 改善の評価 まとめ 前提 クラウド基盤: AWS 言語: Python ライブラリ: DEAP 背景と課題 ある案件で、遺伝的アルゴリズム (以下、GA)を用いた最適化処理により業務改善の実証実験をしていたところ、性能に課題があるということでデータサイエンティストチームから相談を受けました。 当該処理は、EC2 (r7g.4xl
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