2019年10月25日のブックマーク (2件)

  • 包括的なメタゲノム解析パイプライン ATLAS - macでインフォマティクス

    2019 10/26関連ツール追加、10/26 インストール手順修正、10/29 同上、10/29 コメント追加 2020 6/28 論文とツイート追記、実行手順は確認中、2/7, 4/27, 4/29 インストール手順とラン手順追記 2021 5/1  dockerインストール追記、5/12 バグ修正手順追記(非公式です) 2022/04/17 v2.9.1 インストール 2022/06/25  インストール追記 メタゲノミクスおよびメタトランスクリプトミクス研究は、多様な環境からの微生物集団の組成および機能に関する貴重な洞察を提供するが、培養株の遺伝子カタログまたはゲノムデータベースへのリードマッピングに依存するデータ処理パイプラインは、未培養微生物の遺伝子および機能的可能性を過小評価した結果をもたらす。シークエンスアセンブリ法の最近の改善により、ゲノムデータベースへの依存が緩和され、

    包括的なメタゲノム解析パイプライン ATLAS - macでインフォマティクス
    sayamatcher
    sayamatcher 2019/10/25
    “メタゲノムシークエンスとメタトランスクリプトームのデータの生のシークエンスリードをアセンブリし、アノテーション付け、定量し、ビニングし、機能的および分類学的アノテーション付けまで行うATLAS”
  • CiNii 図書 - 生命科学者のためのDr. Bonoデータ解析実践道場

    生命科学者のためのDr. Bonoデータ解析実践道場 坊農秀雅著 メディカル・サイエンス・インターナショナル, 2019.9 タイトル別名 Dr. Bono's hands-on guide to biological data analysis データ解析実践道場 : 生命科学者のための : Dr. Bono タイトル読み セイメイ カガクシャ ノ タメ ノ Dr. Bono データ カイセキ ジッセン ドウジョウ

    sayamatcher
    sayamatcher 2019/10/25
    ほぼ発売1ヶ月。CiNiiにもエントリができてて、所蔵館が出てきている。現在3 #DrBonoDojo