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cytoscapeの検索結果1 - 13 件 / 13件

  • 地下アイドル間の関連性をネットワークとして分析したり楽曲派を可視化したりしてみた話 - 蛇ノ目の記

    地下アイドルアドベントカレンダー 12/16の記事です。メリークリスマス。 12/16の記事です。 12/16の( adventar.org 前回の更新から8ヶ月以上が経ってしまった。更新をサボっている間に名古屋に行ったり、大阪に行ったり、福島に行ったり、名古屋に行ったり、大阪に行ったり、名古屋に行ったり、名古屋に行ったり、大阪に行ったり、名古屋に行ったりしていた。さて今年は何回名古屋に遠征したでしょうか。名古屋は近所わかる。 アイドル現場まとめは、"その月に行った現場のまとめ"に留めないと持続可能性が低いと痛感。感想などを細かく書いていくとコストが大きくなりすぎてしまう。来年からはもっと簡素にまとめたい。 それでは本題始まります。 概要 Spotify Web APIを用いて「関連アーティスト(アプリ上では"ファンの間で人気"と表示される)」を取得し、地下アイドルの関連アーティストネット

      地下アイドル間の関連性をネットワークとして分析したり楽曲派を可視化したりしてみた話 - 蛇ノ目の記
    • BlueTeam CheatSheet * Log4Shell* | Last updated: 2021-12-20 2238 UTC

      20211210-TLP-WHITE_LOG4J.md Security Advisories / Bulletins / vendors Responses linked to Log4Shell (CVE-2021-44228) Errors, typos, something to say ? If you want to add a link, comment or send it to me Feel free to report any mistake directly below in the comment or in DM on Twitter @SwitHak Other great resources Royce Williams list sorted by vendors responses Royce List Very detailed list NCSC-N

        BlueTeam CheatSheet * Log4Shell* | Last updated: 2021-12-20 2238 UTC
      • COVID-19のデータでネットワーク図を作成した。 - Qiita

        はじめに 厚生労働省のCOVID-19の感染状況のデータを基に、グラフやネットワーク図、データテーブルを作成し、Webアプリケーション化しました。作成したアプリは下のリンクのものとなります。 アプリリンク: https://chomoku.herokuapp.com/covid-19 下はネットワーク図の画面です。 利用しているデータは厚生労働省のサイトから取得しています。スクレイピングといっても、pandasのread_html関数を使っているだけです。下のgithubからも取得できますが、後述するようにアプリからも取得できます。 今回アプリを作成したきっかけは、東洋経済さんの可視化を見て、自分ではこういうところを見てみたいなと思うところがあったのがきっかけでした。 アプリはタブでページが切り替えられ、次の3つの部分に分かれます。 1つ目は普通のグラフを表示するページ。 2つ目がネットワ

          COVID-19のデータでネットワーク図を作成した。 - Qiita
        • 【12/24にGitLab対応!】テキストで自在に「描く」- KrokiではじめるDiagram as Code - Qiita

          【12/24にGitLab対応!】テキストで自在に「描く」- KrokiではじめるDiagram as CodeMarkdownGitLabasciidocVisualStudioCodekroki これは、 NTTコミュニケーションズ Advent Calendar 2020 25日目の記事です。 昨日は @tnoyama さんの「TEKTONとArgoを比較してみた」でした。お楽しみいただけましたか? Krokiとは 本記事では、テキストからの図表生成ツール Krokiを紹介します。最新バージョンは0.9.0です。 公式docs: Kroki! GitHub: yuzutech/kroki: Creates diagrams from textual descriptions! 概要 Kroki!は、テキストから統一的なAPIで、 UML C4 データ可視化 その他図表 を、PNG,

            【12/24にGitLab対応!】テキストで自在に「描く」- KrokiではじめるDiagram as Code - Qiita
          • 【ネットワーク解析】CytoscapeのstringAppを使って、タンパク質間相互作用ネットワーク解析を行う【Cytoscape】 - LabCode

            タンパク質間相互作用ネットワーク解析とは? タンパク質間相互作用ネットワーク解析(Protein-Protein Interaction Network Analysis)は、タンパク質同士がどのように相互作用し、生物学的プロセスやシグナル伝達経路に関与するかを研究する方法です。この解析は、細胞内のタンパク質が形成する複雑なネットワークを理解するために使用されます。 ネットワークの構築: 同定された相互作用を基に、タンパク質間の関係を示すネットワークを構築します。このネットワークは、ノード(タンパク質)とエッジ(相互作用)で構成されます。 データの解析と解釈: 構築されたネットワークを分析して、重要なタンパク質、相互作用のハブ、機能的なクラスターなどを同定します。これには、ネットワークトポロジーの解析や機能的注釈などが含まれます。 PPIは、細胞の振る舞いや疾患のメカニズムを理解するための

            • 【RNA-seq】Cytoscapeの使い方【ネットワーク解析】 - LabCode

              Cytoscapeの魅力の一つは、その豊富なプラグイン(アプリとも呼ばれる)です。これらのプラグインは、ユーザーが特定の分析やビジュアライゼーションのニーズに合わせてCytoscapeの機能を拡張することを可能にします。 Cytoscapeのプラグインリストは、Cytoscape App Store(http://apps.cytoscape.org/)で確認でき、Cytoscape開発チームによって知られているすべての公開プラグインがリストアップされています。 今回は遺伝子発現データの可視化、ネットワーク解析、および生物学的経路の探索を助ける代表的なプラグインを解説したいと思います。 Cytoscapeをインストールする まずはCytoscapeをインストールしていきましょう。以下のサイトにアクセスしてダウンロードしてください。 https://cytoscape.org/ ダウンロード

              • GitHub - xyflow/awesome-node-based-uis: A curated list with resources about node-based UIs

                baklavajs - Graph/node editor for VueJs beautiful-react-diagrams - React components and hooks to build diagrams butterfly - Renderer for interactive diagrams and flowcharts cytoscape.js - Canvas based renderer with utilities and algorithms diagram-maker - Interactive editor for any graph-like data Flowy - Flowchart library flow-builder - React-based renderer for workflows and process diagrams GoJS

                  GitHub - xyflow/awesome-node-based-uis: A curated list with resources about node-based UIs
                • A CSS-Inspired Syntax for Flowcharts

                  A CSS-Inspired Syntax for Flowcharts Improving the flowchart fun language TL;DR This is an article about stumbling into an interesting syntax for describing graphs. If you want to see it in action you can head straight for the demos! Some Context About 18 months ago I created Flowchart Fun: an app for generating flowcharts from text. To create your flowchart, the app determines the nodes and edges

                    A CSS-Inspired Syntax for Flowcharts
                  • ネットワークグラフ描画ライブラリ7個まとめ - Qiita

                    参考ページ D3.js D3.js v4/v5 force simulation 最小構成 – サンプル d3.jsでスゴイっぽい図(force layout)を作ってみたら思ったより簡単だった件 sigma.js How to use Sigmajs to display your graph ? vis.js Network Examples vis.jsを使ってネットワークを書く vis.jsでグラフ描写 VivaGraphJS VivaGraphJS Amazon Visualization Cola.js Cola.js cola.jsによるデータビジュアライゼーション Cytoscape.js Cytoscape.jsを試してみた Cytoscape.js でインタラクティブなグラフ構造描画 - WordNet の可視化例 自律分散監視システムとそれを利用したネットワークグラフ

                      ネットワークグラフ描画ライブラリ7個まとめ - Qiita
                    • YOASOBIさん「アイドル」の記録的人気をリツイートネットワークから可視化してみる|こちら徒然研究室(仮称)

                      赤坂アカさん原作、横槍メンゴさん作画の漫画のアニメーション化作品『推しの子』のオープニング主題歌『アイドル』が、配信開始数日で再生/視聴回数を伸ばし、各種記録を更新しつつあるようです。 #YOASOBIアイドル MV1,500万回再生💥 そして全世界でのサブスク再生回数が1,000万回を突破しました💥 アニメ【 #推しの子 】と一緒に、世界中からたくさんの愛を受け取っています。本当にありがとうございます。 アニメ次回は明後日23時から!1話の視聴はお済みですか?😈https://t.co/bR5sMb4jgh pic.twitter.com/CrK7vxdoST — YOASOBI (@YOASOBI_staff) April 17, 2023 このときは「ファンダム」という観点から非常に興味深い現象が観察されたのですが、今回はどうでしょうか? そこでYouTubeでの同曲MV公開日

                        YOASOBIさん「アイドル」の記録的人気をリツイートネットワークから可視化してみる|こちら徒然研究室(仮称)
                      •  インタラクティブ・データビジュアライゼーション入門  |朝倉書店

                        Webサイトで公開できる対話的・探索的(読み手が自由に動かせる)可視化をPythonで実践。データ解析に便利なPlotly,アプリ化のためのユーザインタフェースを作成できるDash,ネットワーク図に強いDash Cytoscapeを具体的に解説。 ◎本書の刊行を記念しまして、ジュンク堂池袋店様にて、オンラインイベントが開催されます。 ○演題:Pythonインタラクティブ・データビジュアライゼーション入門 -COVID-19のデータを使ったインタラク ティブ可視化事例- ○日時:2021年1月12日 19:30~21:00 *申し込みなどの詳細は、丸善ジュンク堂のサイトにてご確認ください。 グラフ(棒グラフ,散布図,ヒートマップ・・・)や表,地図,ネットワーク図など,簡潔なコードですばやく可視化 オールカラー ●コールバック,アニメーションなどの機能で,大規模データでも特徴把握が簡単に ●統

                           インタラクティブ・データビジュアライゼーション入門  |朝倉書店
                        • Interactive Graph Visualization in Jupyter with ipycytoscape

                          The Jupyter widgets ecosystem offers a broad variety of data visualization tools for exploratory analysis in the notebook. However, we lack a good story for exploratory graph visualization. Cytoscape is an open-source software platform for visualizing complex networks and integrating these with any type of attribute data. While it comes from the computational biology community, cytoscape is fully-

                            Interactive Graph Visualization in Jupyter with ipycytoscape
                          • 令和6年にJavaScriptなチャートライブラリをReact念頭に置いて総ざらい - Qiita

                            はじめに Next.js の SSG で簡単な線グラフを表示する必要に迫られ、その界隈で使われているライブラリの現状をちょっと調べてみました。以前に同じ界隈のグラフ表示のライブラリを使ったのは 2018 年頃なので、最近の状況を把握する目的もあります。 チャートライブラリは特定の目的のものから汎用的なもの、チャートを簡単に表示するものから部品のラッパー的なものまで多種多様ですが、既に開発が終了/停滞しているプロジェクトも多く、調査にはそれなりに時間がかかってしまいました。 ライブラリ調査/選定について 英語版の Wikipedia に結構まとまっているので、まずはそこから列挙したあとに絞り込んでいきました。今回の利用目的から、非プロプライエタリ、かつ、比較的更新がされており、PC 上の Web ブラウザ上での表示がメインで Reace(Next.js/SSG) で利用でき、オフライン表示も

                              令和6年にJavaScriptなチャートライブラリをReact念頭に置いて総ざらい - Qiita
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