左右に分割されたウィンドウではtruncate-linesがtでも折り返されないことがあります。それはtruncate-partial-width-windowsがtなど(非nil)になっているためでしょう。 truncate-partial-width-windowsをnilに設定すると、truncate-linesに従って、折り返し・非折り返しをトグルできるようになります。 (setq truncate-partial-width-windows nil)を~/.emacsにいれておくとよいです。 参考: http://www.bookshelf.jp/texi/elisp-manual-20-2.5-jp/elisp_39.html#SEC622