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Homebrew/scienceでバイオインフォマティクスのソフトウェアを入れる - Wolfeyes Bioinformatics beta
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Homebrew/scienceでバイオインフォマティクスのソフトウェアを入れる - Wolfeyes Bioinformatics beta
Homebrew/homebrew-science Homebrewにはtapというコマンドがあって，例えばHomebrew/dupesのようにMacO... Homebrew/homebrew-science Homebrewにはtapというコマンドがあって，例えばHomebrew/dupesのようにMacOSXに標準で入っているソフトウェア/パッケージを個別に入れられたりと，公式以外のフォーミュラからbrewコマンドで入れられるシステムがある． その中でHomebrew/scienceという科学系のリポジトリがあり，バイオインフォマティクスに関するソフトウェアも多数登録されている．例えば， blast blat hmmer clustal-w のような基本的なソフトウェアから， bowtie2 cufflinks bwa fastqc igv samtools bedtools … のようなNGSまわりの解析ツールもひと通りHomebrewから入れることができる．ここに挙げている以外にも多数のバイオインフォマティクス関連のソフトウェアが登録さ
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