Rのちょっと速いコードの書き方

Rはループ速度が段違いに遅いと言われる。確かにループとメソッド呼び出しで構成したマイクロベンチマークを実行すると、Javaが6.32秒、C++で6.33秒で終わる処理が、87時間18分16.0秒（推定値）かかったりする。S-PLUSやMatlabなどの他の同種の言語よりは高速か同等と指摘されているが、汎用言語に比べると断然遅い（Benchmark 2）。 もちろん大半の計算は問題ない。標本数１万ぐらいのサンプルでプロビット分析を行っても、1秒もかからず計算が終わる。コマンドを打っている時間の方が圧倒的に長い。しかし人間はどのような環境でも速度に憧れるものだ。そしてRでも短時間に処理を終わらせる為のコツはある。 1. パッケージや内部関数を使う 大抵の著名パッケージはC言語で実装されているので、内部的な処理は高速だ。Rではなるべくコードを書かない方が良い。スクリプト言語やインタープリッタ全般

[Rion778]

applyって内部でfor回してるしforが遅いのは書き方の問題では。。。みたいな話題ちょくちょく見るよね。

[yasudayasu]

そして大して速くもならないコード高速化に時間を費やす、という本末転倒に到れば立派なR使い。まあ、出来合いを使う、添字操作を避ける、ベクトル等のサイズを固定する、が重要かな。