CubePDF は仮想プリンター形式の PDF 変換・作成ソフトです。 プリンターで印刷するのと同じ操作で、印刷可能なあらゆるファイルを PDF, PNG, JPEG 等のファイルに変換することができます。

##はじめに OS標準で入っているケースが多いzlibですが、OSの最小インストールなど状況によってはインストールされていないことがあります。 今回は、ソースからコンパイルしてインストールする方法をメモしておきます。 RockyLinuxは、RHEL互換OSのためAlmaLinuxなどのRHEL互換OSであればどれも同様に対応可能です。 2023年4月現在、zlibの最新版は「1.2.13」となります。 ##環境 プロダクト バージョン

定量的PCRと遺伝子発現の評価 定量的PCR（以下、qPCR）の用途の一つに遺伝子発現の評価があり、これはmRNAのコピー数から測定されます。少量のRNAから遺伝子発現を検出し定量化するためには、定量的逆転写PCR（以下、RT-qPCR）による増幅が欠かせません。 この記事では、RT-qPCRの基礎となる逆転写PCR（以下、RT-PCR）について解説し、その後、RT-qPCRにおいてよく生じる問題とその解決方法について紹介します。 無料PDF(PCR技術のすべて)はこちら RT-PCRの概要 RT-PCRは、RNAを増幅するための技術です。DNAポリメラーゼは1本鎖RNAを増幅することができないため、鋳型RNAからcDNAを作るためには逆転写が必要です。鋳型RNAから逆転写されたcDNAは通常のPCRか、場合によってはqPCRプロトコールを用いて増幅されます。 逆転写については、様々な逆転

A 水300cc、ガラスープの素小さじ2、醤油大さじ2、酒大さじ1、オイスターソース小さじ1、砂糖小さじ1、塩ひとつまみを合わせて合わせ調味料を作る。 B 片栗粉大さじ1　1/2、水大さじ1　1/2を合わせて水溶き片栗粉を作る。

来年でP-MODELデビュー40周年を迎える平沢進。「テクノポップ御三家」と言われたP-MODELを、その絶頂期に路線変更。インターネットには黎明期から注目し、いち早く「インタラクティブライブ」やダウンロード配信を行うなど、未開の地を切り開いてきた。常に時代の一歩先を見据えてきた平沢から、次世代を担う若者たちへのメッセージをお届けする。 それまでミュージシャンは「ミュージシャン」であるために、妥協がたくさん必要でした。 —平沢さんは、インターネット黎明期から積極的にインターネットを活用されてきました。そもそも、インターネットのどこに魅力を感じたのでしょうか。 平沢：1980年代の終わり頃からデジタル技術が著しく発達し、ミュージシャンが「個人」でできる範囲もどんどん広がっていきました。その頃から、音楽制作から流通に至るまでのプロセスにおける最後の部分、つまり「情報発信」とダウンロードを含めた

アトラスは、2月16日にPS4向けドラマチックアドベンチャーゲーム『十三機兵防衛圏』のプレミアム・トークイベントを都内の「TUNNEL TOKYO」で開催した。今回のイベントは、先着購入特典として付属していた参加応募券で応募したファンの中から、抽選で選ばれた130名を招待して行われたものだ。 当日はあいにくの雨模様だったが、それを吹き飛ばすほどの熱量で会場には多くのファンが集結。一足お先に購入できるグッズに列を作ったり、声優陣のサイン色紙を写真に収めていたりと、開演前の雰囲気を楽しんでいるようだった。 ちなみに本イベントは“ネタバレ全解禁”という趣旨で開催されたものだ。どちらかというと、裏設定などファンが知りたかった話しがいろいろと聞けたという感じで、ゲーム自体の面白さが半減してしまうというものではない。 しかし、ストーリーに関する話題も数多く出たので、本編クリア後推奨の内容となっている。

世の研究者たちはFASTAファイルのハンドリングにはどのようなツールを使っているのだろうか。 長さでソートしたい 特定の文字列を持つものだけ抽出したい 名前だけ抽出したい 名前を置換したい/通しで付け直したい でかすぎるファイルを分割したい ランダムサンプリングしたい といった欲望は、シーケンスを扱うすべての研究者たちが持っていそうなものだけど、調べてみても、意外と統一的な方法って無くて、各自が自分なりの方法で作業してるのが実情みたいだ。自分自身もbioperl, biopython, bioawkなど、色々なツールをかじってみたけれど、どれもとっつきにくくて、結局、一番使い慣れているRにパッケージ"seqinr"を入れて作業する方法に落ち着いていた。けどこの方法は、もともと文字列処理が得意でないRに無理矢理FASTAを読み込ませているところもあるので、次世代シーケンサーで出てくるバカでか

2019 4/15  Githubリンクの誤り修正、7/3 名前修正、12/11 論文引用追加、タイトル修正 2022/06/07 インストール手順修正 デノボシーケンスアセンブリは、比較的短いシーケンシングリードからサンプルゲノムを再構築する。リファレンスゲノムは関心のある領域を欠いている可能性があるため、マッピングベースの分析に失敗することが多い、新種および構造ゲノムの変化の研究に不可欠である。 Pacific Biosciences（PacBio）およびOxford Nanopore Technologies（ONT）による一分子シークエンシング技術の急速な進歩により、10〜100キロベース（kb）のリードを手頃なコストでシークエンスすることができる。このようなロングリードは霊長類の主要なrepetitiveクラスを解決し、アセンブリの連続性を改善するのに役立つ。今日では、いくつかの

第3世代シークエンシング技術は、高品質でウルトラロングリードを生成できることから人気を博している。さまざまなサンプルや複数のシーケンスプラットフォームから得られたデータセットを比較および包括的な解析に活用することは、生物学的メカニズムの解明やベンチマークベースラインの確立に不可欠である。しかし、既存のロングリード用ツールは、主に個々のサンプルの品質管理（QC）とリード処理に重点を置いているため、複数のデータセットのプロファイリングと比較が複雑になっている。また、データの比較や結果の可視化のためのツールがないため、バイオインフォマティクスの経験が浅い研究者には困難が伴う。さらに、適切なシークエンシングプラットフォームを選択するために重要なベンチマークベースラインは、マルチサンプルおよびマルチプラットフォーム間での比較解析と可視化を容易にする包括的なロングリードQC手法の開発が必要である。Py

今回の統合TVは、自分のコンピュータでBLAST検索を実行する方法を紹介します。 現在、さまざまなデータベースに対してウェブ経由でBLAST検索を実行できます。 しかしながら、実行速度が遅かったり、大量に検索すると怒られたり、自分の望むデータベースがなかったりする場合があります。また、まだ公開していない配列データに対してBLAST検索を実行したい場合もあるかもしれません。 そんなときには、自分のコンピュータにBLASTをインストールして、ローカルでBLAST検索を実行してしまいましょう!今回はその第二弾、”検索実行・オプション編”としてBLASTプログラムの検索実行やオプションをを使っての実行方法について紹介します。 検索実行では前回作成した酵母のアミノ酸配列データベースに対して、サンプル配列と類似の配列を検索しています。オプションの実行では、さまざまなオプションを使って検索結果をしぼった

パルプ・フィクションのハンバーガーが美味そうって話を思い出した あと、ゴーゴー夕張は元気だろうか

2019 4/15 Githubリンク追加 2019 6/21 seqmit sample コマンド追記 2019 8/7 help追加 2019 8/8 stats追記 2020 3/18 help更新 2021 ツイート追加（対応するバージョンを使っている人は注意） 2016年に発表されたfastqの操作ツール。競合ツールより多機能とされる。seqtkと同様、動作は非常に早い。メモリ使用量はseqtkより少ないとされる。 マニュアル Usage - SeqKit - Ultrafast FASTA/Q kit チュートリアル Tutorial - SeqKit - Ultrafast FASTA/Q kit 公式マニュアルの機能比較。競合のツールより多機能に見える。 公式マニュアルより。 2023/03/22 SeqKit has got 1000 citations 🎉 We've

『十三機兵防衛圏』の制作秘話を公開！ ヴァニラウェアインタビュー第1弾をお届け!!【電撃PS】 文 電撃PlayStation 公開日時 2020年02月10日(月) 12:15 2019年11月28日の発売以降、そのクオリティの高さで多くのユーザーから支持を受け、口コミなどでも人気が広がり続けているPS4のドラマチックアドベンチャー『十三機兵防衛圏』。アトラス×ヴァニラウェアがタッグを組んで放った本格SFの世界は、美しいビジュアルや練り込まれた物語、爽快感あふれるシミュレーションバトルなどで構成されており、その魅力は一言では語り尽くせないでしょう。 今回は多くの根強いファンを獲得した本作について、2019年12月28日発売の“電撃PlayStation Vol.683”では掲載しきれなかった、本作の貴重なヴァニラウェアのインタビュー第1弾をお届けします。 和やかな雰囲気のもと行われた取材

「我思うゆえに、我あり」ではない 「我、他者とコミュニケーションする」、故に、我あり Word creates world！ （やりとりされた言葉こそが、現実をつくる） ・ ・ ・ これらは、いわゆる「社会構成主義」とよばれる思想の基本テーゼです。 ここで「社会構成主義」とは 1．意味や現実とは、個人の頭の中で、つくられるのではなく 2．ひとびとが物事をやりとりしているなかで、 3．ソーシャルにつくられていくのだYO！ という考え方のことをいいます。ここ数十年、もっとも注目される理論のひとつですね。 もちろん、これらの需要期の定義、「その筋の専門家」の耳に入ったとしたら、便所スリッパでカンチョーされて、さらにグリグリされそうな「3行要約」ですが、ここはブログ。どうかお許しください（笑）。 ▼ ところで、社会構成主義のことを考えていて、いつも、「あるあるの事例だな」と妄想してしまうことのひと

“今年最高のゲーム” 複雑な人間関係・時代関係がカタルシスへと直結していく、尖りすぎた近年最高峰のＳＦアドベンチャーゲーム！！──『十三機兵防衛圏』 - 基本読書 “もう一度言うが大傑作だ” 『十三機兵防衛圏』レビュー。ゲームで物語を語る一つの完成形にして究極のカタチ。 - 社会の独房から “世界一贅沢なSF小説” 【クリアレビュー】青春×ロボット×空想科学、全部盛りセンスオブワンダーの傑作SF小説 ～十三機兵防衛圏 ネタバレなし - 南極ゲーム観測所 “何重にも張り巡らされた点と点がすべて繋がった時は、シナプスが発火しまくった結果、脳が炎上、焼きただれてしまいました” 十三機兵防衛圏、面白すぎた日記 - 2020/01/09 - K Diary 2019年末から2020年1月頭ごろにかけ、SNSなどでの口コミが急増し話題沸騰。公式から品薄のアナウンスまでなされた、とあるゲームがあります。

ブログへのアクセスを増やしたいな。 被リンクが多ければいいって聞いたんだけど、被リンクは自分でも増やせるの？ 自分で被リンクを増やしたいんだけど、どのサイトを使えばいいか教えて！ 今回は、わたしのサーチコンソール管理画面で本当に被リンクとして確認されたサイトをご紹介します。 これを見たあとは、すぐにあなたも被リンクを貼ってみてくださいね。 それでは早速みていきましょう！ （この記事は2020年3月に追記・再編集しました） ブログに自然な被リンクを自分で増やせるサイト6選あなたのブログに自然な被リンクを自分で増やせるサイトはこちらです。 note（ノート）はてなブックマークlinktr.ee（リンクツリー）Adobe Portfolio（アドビポートフォリオ）Behance（ビハンス）Smart.bio 【番外編】Pinterest（ピンタレスト）[OsusumeLink id="400"]