理研、ゲノムデータベース検索ソフトをオープンソースで公開 | OSDN Magazine独立行政法人理化学研究所は、同研究所で開発したゲノムデータベースの検索ソフト「オミックスブラウズ」を2006年11月1日、オープンソースで公開した。ゲノムの膨大なデータ量でも表示範囲の制限を受けず、ゲノム地図の全体像を俯瞰できるのが特徴。ライセンスはGPL。 ゲノム上に存在する遺伝子などのさまざまな情報に関するデータベース群を同時に検索して可視化するソフトで、膨大なゲノムデータを統合するデータサーバと、ゲノム地図を可視化できるビューワで構成される。 データサーバはMySQLとJavaサーブレット、設定ツールからなり、複数のデータベースを連携させて膨大なデータも分散配置できる。また、複数のデータベースへのアクセスを1回にまとめて行うため、データ増に伴うネットワーク負荷を軽減できる。 ビューワはFLASHを使って作成してあり、ゲノム情報をベクター画像で可視化して表示し、全体像の俯瞰から注目する
