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tipsとconsedに関するgaogaosanのブックマーク (1)

  • phred/phrap/consedを使う

    phred/phrap/consedは米国ワシントン大学のProf. Phil Greenのプロジェクトで誕生したソフトである.ABIなどのオートシーケンサーのファイルからのベースコール(純正のベースコールよりも正確という),配列の連結(アセンブル),元の波形データを参照しながらのコンティグの編集という,買えば数10万円以上する高機能ソフトウエア一式が,アカデミックユーザーには無料で試用できる.ただし,アカデミックユーザーにはバグレポートが義務付けられている. インストールから始めるときにはこのまま,システム管理者からアカウントをもらってインストール済みのシステムを利用するユーザーは 4.ユーザー側の設定 以降を参考にされたい.ユーザー側の設定も誰かにしてもらった場合には5.ベースコールとアセンブル以降を参考にされたい. 1.ソフトの入手 http://www.phrap.org に入手の

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