ハイパーリンクをクリックしても何も起きないという主張があれば、リンクのクリックでSafariがクラッシュするという声もある。 この問題の原因は、「Universal Links」という新しい機能にあるようだ。これは、ウェブ開発者が、特定のリンクをブラウザのSafariに向かわせるのではなく、独自のアプリで開くよう指定できるというものだ。この機能はiOS 9で初めて導入されたが、「Bookings.com」や「Wikipedia」など一部のアプリがユニバーサルリンクの関連付けファイルに加えているリンクが多すぎるとみられ、これがiOS 9.3(および一部の報告によれば「iOS 9.2.1」)でハイパーリンクを壊している。 モバイル専門家のBen Collier氏は、問題が起きる過程を次のように説明している。