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  • Python lifelines で生存分析 - StatsFragments

    サイトのアクセス履歴をみていたら "Python", "生存分析", "Kaplan-Meier" なんかがちらほらあったので、知っている方法を書いてみる。 生存分析とは いくつかのサンプルについて、何らかのイベントが起きるまでの時間とイベント発生率との関係をモデル化するもの。よく使われるのは 何かの病気になってからの死亡率 部品の故障率 など。 この説明がわかりやすい。 Rと生存時間分析(1) Python でやる方法 どちらか。lifelines のほうが手間はすくない。 lifelines パッケージを使う rpy2 でデータを R に渡して survival パッケージ を使う 1. lifelines パッケージを使う これを使えば Pure-Python で生存分析できる。使えるのは、以下のノンパラ、セミパラ系の手法。Weibull などのパラメトリック系はない (Scipy

    kimigayoseishou
    kimigayoseishou 2017/12/07
    Python