Cytoscapeとは? Cytoscapeとは、欧米の研究機関によって開発されているオープンソースのネットワーク可視化ソフトウェアプラットフォームです。ネットワーク(数学の用語ではグラフ)可視化ソフトウェアとは、要するにデータを分析して、最終的には以下の様な描画を行うものです。 元となる情報は基本的に何でも良いので、以下の様な分野で利用されています: 遺伝子ネットワーク分析(主な開発目的です) ソーシャルネットワーク分析(日本語でも幾つか著作のあるJames Fowler教授にも協力していただいています) コンピュータ・ネットワークの可視化とセキュリティ分析 オントロジー等、グラフ構造を持つデータの可視化 このソフトウェアはもう10年以上も開発が続いています。私もカリフォルニア大学のチームの一員として、かなり初期から開発に加わっておりますが、私の努力不足もあり、日本語のドキュメントはとて
![ネットワーク可視化プラットフォームCytoscapeの現状まとめ - Qiita](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/7074f78e5ea331437a56357f9c3b7eaf3808ff1a/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fqiita-user-contents.imgix.net%2Fhttps%253A%252F%252Fcdn.qiita.com%252Fassets%252Fpublic%252Farticle-ogp-background-9f5428127621718a910c8b63951390ad.png%3Fixlib%3Drb-4.0.0%26w%3D1200%26mark64%3DaHR0cHM6Ly9xaWl0YS11c2VyLWNvbnRlbnRzLmltZ2l4Lm5ldC9-dGV4dD9peGxpYj1yYi00LjAuMCZ3PTkxNiZoPTMzNiZ0eHQ9JUUzJTgzJThEJUUzJTgzJTgzJUUzJTgzJTg4JUUzJTgzJUFGJUUzJTgzJUJDJUUzJTgyJUFGJUU1JThGJUFGJUU4JUE2JTk2JUU1JThDJTk2JUUzJTgzJTk3JUUzJTgzJUE5JUUzJTgzJTgzJUUzJTgzJTg4JUUzJTgzJTk1JUUzJTgyJUE5JUUzJTgzJUJDJUUzJTgzJUEwQ3l0b3NjYXBlJUUzJTgxJUFFJUU3JThGJUJFJUU3JThBJUI2JUUzJTgxJUJFJUUzJTgxJUE4JUUzJTgyJTgxJnR4dC1jb2xvcj0lMjMyMTIxMjEmdHh0LWZvbnQ9SGlyYWdpbm8lMjBTYW5zJTIwVzYmdHh0LXNpemU9NTYmdHh0LWNsaXA9ZWxsaXBzaXMmdHh0LWFsaWduPWxlZnQlMkN0b3Amcz0wNmUwZGUzZjg2MjliODM4YTk5YTcyMjg0YzIyZjRmOQ%26mark-x%3D142%26mark-y%3D112%26blend64%3DaHR0cHM6Ly9xaWl0YS11c2VyLWNvbnRlbnRzLmltZ2l4Lm5ldC9-dGV4dD9peGxpYj1yYi00LjAuMCZ3PTYxNiZ0eHQ9JTQwa2Vpb25vJnR4dC1jb2xvcj0lMjMyMTIxMjEmdHh0LWZvbnQ9SGlyYWdpbm8lMjBTYW5zJTIwVzYmdHh0LXNpemU9MzYmdHh0LWFsaWduPWxlZnQlMkN0b3Amcz1lZTA4NzYyMmU5NzViMmQxYzNkOTEyMjdjMTA3ZjU0Mw%26blend-x%3D142%26blend-y%3D491%26blend-mode%3Dnormal%26s%3D423a697ba6545e828d24c7f73db9a816)