squareformとpdistに関するoratosaのブックマーク (1)

  • 【python】scipyのpdistとsquareformの使い方と仕組み - 静かなる名辞

    はじめに scipyで距離行列を扱うときはscipy.spatial.distanceのpdist, squareformなどを主に使いますが、長年よくわからないままに使っていたので、整理してまとめておきます。 なお、以下のドキュメントを参考にします。 scipy.spatial.distance.pdist — SciPy v1.2.1 Reference Guide scipy.spatial.distance.squareform — SciPy v1.2.1 Reference Guide pdist pdistを使うと様々な距離の距離行列を計算できます。デフォルトはユークリッド距離ですが、他にもいろいろ指定できる距離の種類があります。詳細はドキュメントを見てください。 そしてpdistは「condensed distance matrix」という表現方式の距離行列を返します。この

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