11. • 問い1 ゆがみの無いコイン → 表裏の出る確率は 1/2 • 問い2 ある商店街 → 場所によって男女比が違う 男女の通る確率は不確定 ベイズ確率
![5分でわかるベイズ確率](https://cdn-ak-scissors.b.st-hatena.com/image/square/0a2ced972a6d7b27b17798fad29ef36ea9ad66cb/height=288;version=1;width=512/https%3A%2F%2Fcdn.slidesharecdn.com%2Fss_thumbnails%2F5-131109034918-phpapp02-thumbnail.jpg%3Fwidth%3D640%26height%3D640%26fit%3Dbounds)
列挙してみる 遺伝生殖関係 メンデル メンデルの遺伝の法則 集団遺伝学 木村資生 進化解析 系統樹 連鎖不平衡 遺伝的多様性 家系解析 連鎖解析 ゲノム特化事項 オミックス マルチオミックス 時空間離散化(個人・細胞) 量的生物学 統計関係 フィッシャー 離散変数 カテゴリカル変数 連続変数 多変量解析 離散確率過程 多重検定 多段階解析 統合解析 QC 量子確率論 尤度 ベイズ流 ゲノム疫学 データサイエンス関係 大規模データ解析 機械学習 深層学習 ゲーム理論 量子計算 量子計算機 情報関係 マルチバンディット ボルツマンマシン エントロピー 個人情報 数学関係 微分積分学 線形代数学 グラフ理論 情報幾何 多様体 確率微分方程式 物理学関係 波動関数 量子力学 医療関係 臨床ゲノム学 リスク遺伝子 責任遺伝子 リスクコミュニケーション 遺伝子診断 予防医学 出生前診断 個別化医療 倫
No.05001 R で非類似度行列をクラスター分析にかけたい 【ぞう】 2007/12/10(Mon) 15:45 質問があります。 土田氏作成のPAC分析支援ツール(http://wwwr.kanazawa-it.ac.jp/~tsuchida/lecture/pac-asist.htm)を用いて作成された非類似度行列を,R に読み込ませてクラスター分析を行いたいと思っています。しかし,どのような関数を用いればいいのかわかりません。 非類似度行列は以下のようなものが作成されます。(example) a b c d e f g a 0.0 56.7 28.6 50.1 50.8 50.1 57.5 b 56.7 0.0 36.2 28.6 35.8 64.9 65.1 c 28.6 36.2 0.0 72.6 64.9 64.9 21.4 d 50.1 28.6 72.6 0.0 37
Rパッケージveganを利用した類似度の計算 veganパッケージはR本体には最初からインストールされておらず,最初にCRANや パッケージインストーラーなどからのダウンロード・インストールが必要である.Rを起動し,ツールバーのパッケージをクリックし,表示されたメニューの中 から「パッケージのインストール…」を選んでクリックすると,CRAN mirrorというのが出てくる.その中から,例えばJAPAN (Tokyo)を選ぶと,packagesの一覧が出てくるので,veganを選んでクリックするとveganがインストールされる. 詳細は,土居・岡村(2010?)を参照のこと. # 必要なパッケージの呼び出し library(MASS) library(vegan) # 類似度の計算 # 例データをtestdataに入力 testdata <- matrix(c(100,150,0,10,80
生物群集の解析手法のうち、「多様度指数」と「類似度指数」を簡単に計算することができるマクロです。 個人や企業での使用、配付資料等への添付は自由です。 ただし、マクロに関する著作権等は放棄しておりません。商用での使用をお考えの場合は、弊社までご相談ください。
「Rによる統計解析」 オーム社 刊 サポートページ 目次 第1章 Rを使ってみる 第2章 データの取り扱い方 第3章 一変量統計 第4章 二変量統計 第5章 検定と推定 第6章 多変量解析 第7章 統合化された関数を利用する 第8章 データ分析の例 付録A Rの解説 付録B Rの参考図書など はじめに R とは何か,何ができるかのリンク集(日本のもののみ) R を使うためにはどうしたらいいの? データなどの読み書き R の定石(R に限らずプログラミングの定石も) R を使って実際に統計解析をする AtoZ 一連の流れ データファイルの準備をする 分析してみる 分析結果を LaTeX で処理したり,ワープロに貼り込んだりする 道具立て 連続変数データをカテゴリーデータに変換 カテゴリーデータの再カテゴリー化 度数分布表と度数分布図の作成 散布図・箱髭図の描画 クロス集計(独立性の検定,フィ
リリース、障害情報などのサービスのお知らせ
最新の人気エントリーの配信
処理を実行中です
j次のブックマーク
k前のブックマーク
lあとで読む
eコメント一覧を開く
oページを開く