©2004 Elsevier ScienceScientists can now watch the mouse brain in action thanks to a new technique that lights up specific populations of neurons as they fire.1 Because the fluorescent marker responsible is genetically encoded, it now will be possible to follow an animal throughout its life to see how activity changes during development and learning, says neurobiologist and coauthor Matt Wachowiak
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Our Faculty conceive and deliver our science. Within our strategic framework the Institute’s scientific aspirations are driven by their vision, imagination and intellectual energy. The Institute has four different Faculty types: Faculty, Associate Faculty, Honorary Faculty and International Fellows. Faculty Associate Faculty Honorary Faculty International Fellows
更新履歴 2004/01/07 O(N) 構築アルゴリズム三種追加(Ko &Alulu, Kim & al., Karkkainen & Sanders) Suffix Arrayは、最近注目を集めているデータ構造です。その理由として、 (1)大規模なデータに対して、高速に検索、情報抽出を行うことができる (2)BWTとしてデータ圧縮に用いることができる。 ことが挙げられます。(1)に関しては自然言語処理において、膨大な量のコーパスから情報(例えば、単語の出現回数など)を調べるときににSuffix Arrayを用いると非常に高速に求めることができます。 膨大な量のコーパスに基づいた自然言語処理が盛んになってきている今、Suffix Arrayが注目を集めています。 また、ゲノム情報を調べるバイオインフォマティクスにおいても、ここの配列と似ている部分(例えばCCAG)を調べるといった場合
is a non-for-profit research and development (R&D) organization. Our mission is to create, inspire and incubate innovative ideas in life-sciences. We also promote and facilitate unrestricted and effective research of excellent young Polish scientists. The main scientific focus of the institute is bioinformatics, an inter-disciplinary field of science driven by achievements in biotechnology and inf
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GenomeNet で提供されているデータベースを例にとり、Web ベースのエントリ単位のデータの解析から、ファイル単位の多数のデータを一括して解析する方法への基礎技術を習得します。 1. 実習の予定(10:00〜17:30) 10:00 計算機環境の設定(担当:片山) 13:00 配列データベース解析(担当:伊藤) 14:30 化合物データベース解析(担当:服部) 16:00 パスウェイデータ解析(担当:川島) 2. 参考文献など KGML マニュアル <URL:http://www.genome.jp/kegg/docs/xml/> KEGG API 日本語マニュアル <URL:http://www.genome.jp/kegg/soap/doc/keggapi_manual_ja.html> 3. 前提知識 UNIX のファイル操作ができること(cd, ls, moreなど) 分子生
ACSの主張 ACSが5/23日付で公開した資料によれば,PubChemはCASの複製であって,連邦政府は納税者の支援を受けた競合的な科学出版社になることを求めるべきでないと主張している。NIHの助成とは関連のない低分子情報を収集,組織化,流通させることは自由な科学出版への道を閉ざすものとなるし,PubChemに集めれらたデータがパブリックドメインにあることは何ら関係がなく,情報を集めそれを多様な形態で公開するのは,民間部門のすることで,現時点では,収録データがCASと比較して少ないけれど,今後追加されればそれは脅威となる。 NIHその他の主張 当事者のNIHの主張は,PubChemとCASの両者に重複するものは3%ほどで収録の範囲も異なるのであるし,CASは化学文献や特許,化学反応へのリンクを張っているのであるから,競合的とか複製物というよりは補足的なものである(ACSは約100万の化学
The Biomart system (http://www.biomart.org/) is a flexible data warehouse aimed at complex interlinked biological data sets. Originally developed for the Ensembl project it has now been generalized to allow other data providers access to its functionality. As an example the EBI's Biomart instance contains data from Ensembl, VEGA, DbSNP, UniProt and MSD data sets - Taverna's biomart query integrati
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