スパコン「京」で抗がん剤の候補物質作製に成功 : 科学 : 読売新聞（YOMIURI ONLINE）
東京大と富士通、製薬会社の興和は、理化学研究所の世界最速級のスーパーコンピューター「京（けい）」（神戸市）を活用して、抗がん剤の候補物質を作製することに成功した。 「ＩＴ創薬」と呼ばれる方法で、高い治療効果が見込める薬を効率的に作る新たな技術として注目される。 研究チームは、がん細胞の表面にある増殖に重要な役割を果たすたんぱく質に着目。たんぱく質の「鍵穴」に「鍵」のように入り込み、細胞増殖を抑える化学物質をスパコンで設計した。たんぱく質と化学物質が引き合う力や体内の水分の影響など複雑な計算を、スパコンを使うことで精密に行うことが可能になった。 スパコンでの化学物質の設計は富士通が担当。興和が実際に化学的に合成できるか検証した。東大は設計方法の改良などを担った。
近畿大学、富士通のスーパーコンピュータ「PRIMEHPC FX10」を導入 : 富士通
PRESS RELEASE 2012年3月29日 近畿大学 富士通株式会社 近畿大学、富士通のスーパーコンピュータ「PRIMEHPC FX10」を導入 私立大学で初めて、「京（けい）」とソフトウェア互換性のあるスパコンを採用 生物理工学部を中心に最先端研究に活用 近畿大学（本部：大阪府東大阪市、学長：畑博行）は、このほど、富士通株式会社（本社：東京都港区、代表取締役社長：山本正已、以下：富士通）のスーパーコンピュータ「PRIMEHPC FX10」の導入を決定しました。「PRIMEHPC FX10」は、スーパーコンピュータ「京」（注1）とソフトウェア互換性があり、私立大学では、初めての採用となります。 文部科学省は、「京」を用いて戦略的・重点的に研究を推進していく「戦略分野」として「予測する生命科学・医療および創薬基盤」「新物質・エネルギー創成」「次世代ものづくり」などをあげています。生物理
近大、「京」とソフトウェア互換性があるスパコンを導入
富士通は3月29日、同社にスーパーコンピュータシステム製品「PRIMEHPC FX10」が近畿大学（近大）生物理工学部に採用されたと発表した。国内私立大学の採用は初めてで、7月に本格稼働を開始するという。 近大が導入するPRIMEHPC FX10はシングルラックモデル。プロセッサには理化学研究所の「京」に使用した「SPARC64 VIIIfx」をベースとして性能向上を図った「SPARC64 IXfx」を搭載。理論演算性能は2.5テラフロップス。PRIMEHPC FX10と京はソフトウェア互換を実現しているため、将来は両システムによる大規模シミュレーションも実行できるという。 生物理工学部では生物学を中心とした科学技術分野での先端研究にPRIMEHPC FX10を活用する方針。ゲノム・プロテオーム解析や生体分子シミュレーション、脳・神経系モデルシミュレーションなどを計画している。
スパコンと薬。薬作り職人のブログ
スーパーコンピュータ（スパコン）の記事を時々見かけるのですが、スパコンの有用な応用分野として「新薬の開発」がよく挙げられています。 読売新聞 「京」応用スパコン輸出再開…富士通 富士通は７日、来年１月から最先端スーパーコンピューターの輸出を約１０年ぶりに再開すると発表した。理化学研究所と共同開発した世界一の性能を誇るスパコン「京」（神戸市）の技術を応用した新製品を、欧州などの政府機関や企業へ売り込む。 新開発した「ＰＲＩＭＥ（プライム）ＨＰＣ ＦＸ１０」は、「京」よりもＣＰＵ（中央演算処理装置）の性能を向上させ、１台で毎秒２兆５０００億回の計算ができる。１０２４台まで組み合わせることが可能で、最大で毎秒２・３京回（京は１兆の１万倍）の計算速度となる。毎秒０・１京回計算できるスパコンなら、価格は５０億～７０億円になる見込みだ。 現在主流のスパコンは、心臓一拍の動きの解析に２年かかるが、京の計
asahi.com（朝日新聞社）：新型「地球シミュレータ」完成 高速でエコ - サイエンス
３月から運用が始まる「地球シミュレータ」の新型機＝２６日午後、横浜市金沢区、杉本康弘撮影 海洋研究開発機構が建設を進めてきたスーパーコンピューター「地球シミュレータ」の新型機が完成し、横浜市金沢区の同機構横浜研究所で２６日、報道陣に公開された。実際の計算速度は、従来の２．２倍に向上。より精度の高い温暖化予測などに役立てる。３月１日から運用を始める。 地球シミュレータの従来機は０２年から約２年半、世界のスパコンの性能ランキングでトップだった。しかし、高性能スパコンの開発が国内外で相次ぎ、昨年１１月時点では７３位に落ちていた。新型機は１秒間に１３１兆回（理論値）の計算ができ、同月時点のデータと比較すると、世界で１８位程度、国内では１位に相当するという。 ＮＥＣ製で、工費と６年間のリース料は合わせて約１８９億円。６４０台のコンピューターをつないでいた従来機に対して、１台当たりの高性能化が進
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【森山和道の「ヒトと機械の境界面」】 スパコン「京」を使う「次世代生命体統合シミュレーション」とは
