モンテカルロサンプリングFirst part shows several methods to sample points from arbitrary distributions. Second part shows application to population genetics to infer population size and divergence time using obtained sequence data.
「Rによるモンテカルロ法入門」読書ノート：アーカイブ - Wolfeyes Bioinformatics beta
本書は，モンテカルロ法の実践的な解説書であり，統計解析ソフトのRを用いた豊富な実例と練習問題が組まれている．モンテカルロ法とは乱数を用いて数値計算を行う手法の総称であり，本書で扱う内容は乱数の発生からモンテカルロ積分，そしてマルコフ連鎖モンテカルロ法（MCMC）の各種アルゴリズムに至るまで非常に幅広い．たいていの解説には理論に実践演習が付随した形となっており，数学的な理論を軸にして実際にRを用いたコード例が示される． 練習問題を解きつつ読書ノートをまとめてみる そんなこんなで，久保本と並行する形で「Rによるモンテカルロ法入門」を読んでいる．一応MCMCの部分だけひと通り目を通したのだが，最終的にMCMCの実装までひと通りやるにしても一連の流れを簡単にでも追っておかなければと思って，最初の乱数の部分からじっくり読み進めている．これがなかなか難しくて，手も足も出ないところをなんとかRのコードを
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