遺伝子解析ツール集：ホモロジーサーチ
他の方法に比べて桁違いに高速であるBLAST法はホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが、1997年よりギャップを考慮するようになった。NCBIで提供されているBLASTには、 Nucleotid BLAST（標準的なblastn、巨大な配列の場合に用いるMEGABLAST、短い配列に適したパラメーターがセットされたもの） Protein BLAST（標準的なblastp、弱い類似性の検索を高感度に行えるPSI- and PHI-BLAST、短い配列に適したパラメーターがセットされたもの） Translated BLAST Searches（自動的にアミノ酸に翻訳してホモロジー検索を行う。blanstx、tblastn、tblastxがある。） Search for cons
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