ニューロサイエンスはおそろしく広大な分野です。脳と意識についてこれから勉強したい人や、研究をしている人にも面白いと思えるような情報源を目指します。 以前紹介したTemple GrandinのAnimals in Translation という本でおもしろい話があった。 なぜサルはヘビを怖がるのか?スタンダードな考え方は、おそらく次のどちらかだろう。 ① 進化の過程で脳のなかにヘビのようなひょろ長いものを恐れるような回路が出来上がっっている。とくにアミグダラ(扁桃体)などで、ヘビに反応する回路が生まれながらできている。 ② 個体ごとに、過去のヘビとの接触した経験から、ヘビは恐いと学習した。 どちらも、ありそうな話だが疑問が残る。①の場合は、そもそもDNAにヘビとはどういうものかという情報が何らかの形で刻み込まれていなければならない。例えば、視覚野のヘビ風の特徴をコードすることになるエリアから
他の方法に比べて桁違いに高速であるBLAST法はホモロジー検索の方法としては最近もっともよく利用されている。以前はギャップを考慮しなかったためアミノ酸配列のホモロジー検索ではFASTAを使う人も多かったが、1997年よりギャップを考慮するようになった。NCBIで提供されているBLASTには、 Nucleotid BLAST(標準的なblastn、巨大な配列の場合に用いるMEGABLAST、短い配列に適したパラメーターがセットされたもの) Protein BLAST(標準的なblastp、弱い類似性の検索を高感度に行えるPSI- and PHI-BLAST、短い配列に適したパラメーターがセットされたもの) Translated BLAST Searches(自動的にアミノ酸に翻訳してホモロジー検索を行う。blanstx、tblastn、tblastxがある。) Search for cons
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