概要 Linuxのパフォーマンス解析ツールであるperfの使いかたの紹介 背景 個人的にperfよくできてると思うので紹介したいというのと、 パフォーマンスカウンタの読み方ってあんまり知られてないみたいなので、 それの解説を書きたい。 構成 perf について説明したあと、パフォーマンスカウンタの読みかた、見かた、を説明する。 perfとは何か Linuxに付いてくるプロファイラ。 man perf によると、 NAME ---- perf - Performance analysis tools for Linux と、書いてある。名前がひどいのでなんとかしてほしい。 perf の特徴 個人的には、手軽に使えるのが素晴らしいと思う。 2.6.31以降カーネルに標準で付いてる。(Ubuntuだとlinux-tools-common(TODO:あとで確認)で入るはず) 特殊な設定が必要無く、
NCBI BLASTのプロファイルを取らないとどこが遅いのか正確に分からないので とってみることに 環境 CentOS ncbi blast 2.2.24 ソースコードの取得 ソースコードは ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ の ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.2.24+-src.tar.gz を使用 プロファイルを取るようにコンパイル まずソースを解凍してディレクトリに移動 実際にコンパイルするときにプロファイリングを取るようにするには ./configure --with-profiling ってやって./configureを実行すれば良いっぽい ちなみに 普通にソースからリリース用にコンパ
Latest news 06 May 2024 Vampir meets ISC 2024 At booth L19 at the ISC High Performance 2024 conference in Hamburg, Germany we will be showing new ... Latest release 05 Jul 2024 Vampir 10.5.0 released We are pleased to announce the feature release of Vampir 10.5.0. This major release introduces ... Vampir 10.5: Master Timeline Search for MPI_Bcast in the Master Timeline Vampir 10.5: Function Summar
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