この記事はPerl Advent Calendar 2017の14日目の記事です。 先月始めにアドベントカレンダーを知ったのですが、どの記事も面白くてためになりますね！ その流れをぶった切って、Bio::Perlの苦い経験を書いてみました。 序盤の文章は、ほぼPerlと関係ありません。 ニッチな分野でにっちもさっちも行かなかった、消化不良な結果であることをご了承ください。 解決策がもらえると嬉しいです！ 始めに 現在、バイオインフォマティクス1という名のもとに、Ensembl2から取得したラットの塩基配列3のうち、snoRNA4群をNCBI5のサイト6でブラスト7しています。 今回は、ブラスト対象、被ブラスト対象がどちらもラットの塩基配列8でなければなりません（重要）。 この全自動化を試してみました。 理想郷 PlantUML文 以下、各アクションについて説明します。 1. Ensembl

（追記） この記事で書いていた Dockerfile が動かなくなっていたので動くように修正した記事を書きました。 以前は動いていた Dockerfile で permission denied が出るようになった話 | nqou.net（追記ここまで） この記事は、 Perl Advent Calendar 2017 の 13 日目の記事です。 昨日は sago35 さんの 「Strawberry Perl に Minilla をインストールする」でした。 この記事のパッチがあたって、 CPAN からインストールできるようになったようです。 これで、 Windows + Strawberry Perl な方も安心して使えますね。 Minilla - CPAN module authoring tool - metacpan.orgちょっとしたものを作り始める時でも Minilla で雛形