TOP | JBIC 一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアムJBICは、ライフサイエンス分野に関する基盤技術の研究開発を産学官連携の下に行い、その成果を製薬、ITをはじめとする産業界、アカデミア等へ普及することを目的としています。 JBICは、ライフサイエンス分野に関する基盤技術の研究開発を産学官連携の下に行い、その成果を製薬、ITをはじめとする産業界、アカデミア等へ普及することを目的としています。
WikiGenes - Collaborative Publishing
The world's first wiki where authorship really matters (Nature Genetics, 2008). Due credit and reputation for authors. Imagine a global collaborative knowledge base for original thoughts. Search thousands of articles and collaborate with scientists around the globe.wikigene or wiki gene protein drug chemical gene disease author authorship tracking collaborative publishing evolutionary knowledge re
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myPresto Portal myPresto Protal is a graphic user interface (GUI) program for myPresto and GROMACS, available for Windows, MAC and Linux (all 64bit). Last updated on September 25, 2024 myPresto Portal Quick Manual Molecular dynamics simulation cosgene: COnformation SamplinG ENginE A molecular dynamics simulation program for protein, DNA, chemical compound, protein-ligand complex. AMBER and CHARMM
ケムインフォマティクスに虚空投げ
OpenBabelでエネルギー計算ができるようになって、さらに便利になりました。そこで、超シンプルな配座探索プログラム(obconfopt)を作ってみました。 基本的には、ランダムに配座を発生させ、最安定な配座を探すというランダム探索法を採用しています。 Step 1. 初期配座の入力 ↓ Step 2. torsion角をランダムに設定し、新しい配座の生成。 ↓ Step 3. Energy Minimization ↓ Step 4. 前に発生させた配座と異なっていれば保持する。 ↓ Step 5. 終了判定 終了するまでは、Step2からStep5を繰り返します。 ここで、Step2はobrotateを、Step3はobenergyとobminimizeを、そしてStep4はobfitを参考にすることができます。簡単ですので、興味のある方は、作ってみてください。 例としてペンタンを使
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SpinWorks - NMR Wiki
http://www.cbri.u-tokyo.ac.jp/index.html
Reaching for high-hanging fruit in drug discovery at protein–protein interfaces - Nature
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分子モデリングと分子シミュレーション2005 || 東京大学農学生命情報科学大学院教育研究ユニット アグリバイオインフォマティクス 人材養成プログラム